This is a clean of MVC file structures you can use to develop and employ using Phalcon >= 3.0.x
Phacon-php/
├── app
│ ├── cache (.volt compile cache)
│ ├── config (Project configuration and environment vars)
│ │ └── config.php (Phalcon app config)
│ ├── controllers
│ │ ├── BaseController.php
│ │ └── IndexController.php
│ ├── services
│ │ ├── core
│ │ │ ├── ApplicationLoader.php
│ │ │ └── DependencyInjector.php
│ │ └── ServicesManager.php
│ └── views
│ ├── index
│ │ └── index.volt
│ ├── partials
│ │ ├── footer.volt
│ │ └── head.volt
│ └── base.volt
└── public
└── index.php