-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 1
/
Copy pathNATRC.f90
1121 lines (1045 loc) · 51.8 KB
/
NATRC.f90
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
! NATRC.f90
!
! FUNCTIONS:
! NATRC - Entry point of console application.
!
!*********************************************************************************
!
! ПРОГРАММА: NATRC
!
! ЦЕЛЬ: Расчет скоростей неадиабтического перехода между двумя состояниями
!
!*********************************************************************************
include "Phys_func.f90"
include "Reader.f90"
include "Math_function.f90"
include "errors.f90"
program NATRC
use phys_constants
use errors_description
implicit none
! Variables
! Body of NATRC
integer(kind=1):: action, IOS=0, number_states, fin_state0,init_state0
integer(4):: i,j,k,number_atoms,old_number_atoms, kk, counter, numao, charges(3000)
character (LEN =255) name_of_inp
character (LEN =10) labels(3000), old_labels(3000)
integer mask(3000), Nmax(3000), n(3000), nm, mask3(3000), mask4(3000), mask4n(3000), mask5(3000), nj, nv,v
integer nminc(3000), nmaxc(3000), Nmin(3000), mmn, targetc, targetcc, iiii
real(4):: coord(3,3000), mass(3000), nacme(10,10,3000), hess(3000,3000), FCF_value, ValForMask(3000)
real(4):: vec(3000,3000), mode(3000), invec2(3000,3000), invec(3000,3000), mode2(3000), HRFs(3000)
real(4):: UnMul(3000,3000), UnSum(3000,3000), BB(3000,3000), FV(3000), SV(3000), inpres(2,3000)
real(4)::omega(3000), Vsum, Kic, centr_coord(3000), sum_mass, old_coord(3000), Vsum2, step, Vsum2add
real(4)::start_time, finish_time, Evib, delta, residual, centr_x, centr_y, centr_z, Er2, ksi(1:3000)
real(4)::nbe(3000),del_w, Er, sigma0, sigma0s, sigma1, sigma1s, w0, wr, wi, g1r, g1i, stepC, GAP
real(4)::Vsum3add, Vsum3, Vsum1, del_w2, HRFsm(3000), omegam(3000), nbem(3000), threshold, HRFmin, HRFmax
real(4)::minj, maxj, minv, maxv, GV(3000), QV(3000), HR_Q(3000), gradient(3000), KFCF, Kgrad, Kalpha
real(4)::coord_g(3000), elfield(0:10,0:10,3000)
logical EndCycle, flag, label_flag, elf_flag(0:10,0:10)
character (80) coord_init_file, coord_fin_file, nacme_file, hess_file, constwrite, hess_log_file, &
grad_file, elf_file, tr_file, num_ao
complex(4)::resultval, g2v, g1c
common/file_names/coord_init_file, coord_fin_file, nacme_file, hess_file, hess_log_file, grad_file, &
elf_file, tr_file, numao
common/nacme/ coord, nacme, number_atoms, labels, charges
common/hess/ hess, mass, vec, mode
common/eignvv/ invec2, mode2
common/area/ nminc, nmaxc
common/UnMul/UnMul
common/UnSum/UnSum
common/TransMatr/BB, FV, SV
common/grad/ gradient, coord_g
common/elfc/ elfield, elf_flag
external dsyev
intrinsic int, min
interface
function inv(A)
real,intent(in) :: A(:,:)
real:: Ainv(size(A,1),size(A,2)), inv(size(A,1),size(A,2))
real:: work(size(A,1)) ! work array for LAPACK
integer :: n,info,ipiv(size(A,1)) ! pivot indices
end function inv
function HuangRhys(Omega,A,Mass,Ri,Rf,number_modes)
real(4)::HuangRhys(3000), Omega(3000),Mass(3000),Ri(3000),Rf(3000)
real(4)::A(3000,3000)
integer(4)::number_modes
end function HuangRhys
function FCF(P_n, NMRT, nm, mask)
real(4):: P_Mu(3000), FCF
integer(4)::NMRT, P_n(3000), mask(3000), nm, k
character (len=10) let1, let2
end function FCF
function under_mult(HRF, n)
real(4)::under_mult, HRF
integer(4)::n
end function under_mult
function sec_func(n,y,w)
integer n
real y, w, sec_func
end function sec_func
function rotate_molecula(coord_rot,coord_ref,numbers_of_atoms,mass,apar)
integer(4)::numbers_of_atoms
real(4)::coord_rot(3000),coord_ref(3000),mass(3000),rotate_molecula(2,3000),apar(3000)
end function rotate_molecula
recursive function difact(n) result (fav) !Подключается функция для расчета факториала
real fav
integer, intent(in) :: n
end
function wn_c(wl,w0,s0,s0s,s1,s1s,n)
complex(4)::wn_c
real(4)::A,B,C,wl,w0,s0,s0s,s1,s1s,z
integer(4)::n
end function wn_c
function gfun(wn_c,HRFs,omega,nbe,Eif2,NMRT,nm,mask)
complex(4)::gfun,wn_c
real(4)::HRFs(3000),omega(3000),Eif2, nbe(3000)
integer(4)::i,mask(3000)
end function gfun
function g1fun(wn_c,HRFs,omega,nbe,Eif2,NMRT,nm,mask)
complex(4)::g1fun,wn_c
real(4)::HRFs(3000),omega(3000),Eif2, nbe(3000)
integer(4)::i,mask(3000)
end function g1fun
function g2fun(wn_c,HRFs,omega,nbe,Eif2,NMRT,nm,mask)
complex(4)::g2fun,wn_c
real(4)::HRFs(3000),omega(3000),Eif2, nbe(3000)
integer(4)::i,mask(3000)
end function g2fun
end interface
!********************************************
! Блок считывания данных из входных файлов
!********************************************
print *, "---------------------------------------------------------------------------"
print *, " INPUT DATA "
print *, "---------------------------------------------------------------------------"
CALL getarg(1, name_of_inp)
name_of_inp=ADJUSTL(trim(name_of_inp))//".inp"
if (len_trim(name_of_inp) .ne. 0) then
call read_input(name_of_inp) !Чтения входных данных из файла input
else
print *, "Write the input file name in argument."
stop
endif
if (fin_state<=init_state) then
fin_state0=fin_state
init_state0=init_state
else
fin_state0=init_state
init_state0=fin_state
end if
!Вспомогательный финт. Применяется по той причине, что матрица переходов определена в треугольном виде
if (ADJUSTL(trim(grad_file))/="") then
print *, ""
print *, "Gradients in the initial state:"
print *, "(from '"//ADJUSTL(trim(grad_file))//"')"
call read_grad(ADJUSTL(trim(grad_file)))
endif
print *, ""
print *, "Coordinates of the molecule in the initial state:"
print *, "(from '"//ADJUSTL(trim(coord_init_file))//"')"
call read_coord(ADJUSTL(trim(coord_init_file)),1) ! Чтение координат молекулы в начальном состоянии из файла coord_init_file
! Число атомов записывается в number_atoms,
! координаты в coords(1,1:3*number_atoms),
!наименование элемента в labels(1:3*number_atoms)
old_number_atoms=number_atoms
if (number_atoms<2) then !Проверяется, что в молекуле два и более атомов, иначе ошибка.
call write_error(1,20,"")
end if
old_labels=labels
print *, ""
print *, "Coordinates of the molecule in the final state:"
print *, "(from '"//ADJUSTL(trim(coord_fin_file))//"')"
call read_coord(ADJUSTL(trim(coord_fin_file)),2) !Чтение координат молекулы в конечном состоянии из файла coord_fin_file
! Число атомов записывается в number_atoms,
! координаты в coords(2,1:3*number_atoms)
!наименование элемента в labels(1:3*number_atoms)
if (naccalc) then
call read_ef(ADJUSTL(trim(elf_file)),init_state0,fin_state0)
do i=1, 3*number_atoms
nacme(fin_state0,init_state0,i)=elfield(init_state0-1,fin_state0-1,&
i)*charges(i)/eifver
enddo
print *, "Non-adiabatic coupling was calculated basing on the ELF data"
print *, "(from '"//ADJUSTL(trim(elf_file))//"')"
print *, "Non-adiabatic coupling elements (NACME) in the initial state:"
print '(A5,A6,A8,3A17)', "Num", " Elem", " Chrg", "X", "Y", "Z"
do i=1,number_atoms
print '(I5,A4,A5,I5,3F17.8)', i, " ",labels(3*i), charges(3*i), nacme(fin_state0,init_state0, 3*(i-1)+1), &
nacme(fin_state0,init_state0,3*(i-1)+2), nacme(fin_state0,init_state0,3*i)
enddo
elseif (res_mode==1) then
print *, ""
print *, "Non-adiabatic coupling elements (NACME) in the initial state:"
print *, "(from '"//ADJUSTL(trim(nacme_file))//"')"
call read_nacme(ADJUSTL(trim(nacme_file)), number_states_nacme,1)!Чтение матрицы констант неадиабатического
!взаимодействие NACME из файла nacme_file
!Результат записывается в nacme(:)
coord(1,:)=0.0
end if
label_flag=.true.
do i=1,3*number_atoms,3
label_flag=(label_flag .and. (labels(i)==old_labels(i)))
end do
if (.not. label_flag) call write_error(2,8,trim(coord_init_file)//"' and '"//trim(coord_fin_file))
!Проводится контроль, что в файлах с начальной и конечной конфигурациями представлены одни и те же атомы,
! в одном и том же порядка. Если они не совпадают, выдать ошибку
call read_hess(ADJUSTL(trim(hess_file))) !Чтение гессиана, масс атомов и векторов колебаний из файла hess_file
!Гессиан записывается в hess(1:3*number_atoms,1:3*number_atoms)
!Массы атомов, по три на каждый атом, записываются в mass(1:3*number_atoms)
!Собственные вектора масс-взвешенного Гессиана в vec(1:3*number_atoms,1:3*number_atoms)
!Частоты колебаний моды в mode(1:3*number_atoms)
print *, ""
print *, "Coordinates of the molecule in the state, in which Hessian was calculated:"
print *, "(from '"//ADJUSTL(trim(hess_log_file))//"')"
call read_coord(ADJUSTL(trim(hess_log_file)),3) !Чтение координат из гессиан файла
! Число атомов записывается в number_atoms,
! координаты в coords(3,1:3*number_atoms)
!наименование элемента в labels(1:3*number_atoms)
label_flag=.true.
do i=1,3*number_atoms,3
label_flag=(label_flag .and. (labels(i)==old_labels(i)))
end do
if (.not. label_flag) call write_error(2,8,trim(coord_init_file)//"' and '"//trim(hess_log_file))
!********************************************
! Блок вычисления
!********************************************
!!!!Блок выправления координат
nm=3*number_atoms
sum_mass=sum(mass(1:nm))/3.0
centr_coord(1:nm)=coord(1,1:nm)*mass(1:nm)
centr_x=sum(centr_coord(1:nm:3))/sum_mass
centr_y=sum(centr_coord(2:nm:3))/sum_mass
centr_z=sum(centr_coord(3:nm:3))/sum_mass
coord(1,1:nm:3)=coord(1,1:nm:3)-centr_x
coord(1,2:nm:3)=coord(1,2:nm:3)-centr_y
coord(1,3:nm:3)=coord(1,3:nm:3)-centr_z
!Центр масс молекулы в начальном состоянии выставляется в начало координат
sum_mass=sum(mass(1:nm))/3.0
centr_coord(1:nm)=coord(2,1:nm)*mass(1:nm)
centr_x=sum(centr_coord(1:nm:3))/sum_mass
centr_y=sum(centr_coord(2:nm:3))/sum_mass
centr_z=sum(centr_coord(3:nm:3))/sum_mass
coord(2,1:nm:3)=coord(2,1:nm:3)-centr_x
coord(2,2:nm:3)=coord(2,2:nm:3)-centr_y
coord(2,3:nm:3)=coord(2,3:nm:3)-centr_z
!Центр масс молекулы в конечном состоянии выставляется в начало координат
sum_mass=sum(mass(1:nm))/3.0
centr_coord(1:nm)=coord(3,1:nm)*mass(1:nm)
centr_x=sum(centr_coord(1:nm:3))/sum_mass
centr_y=sum(centr_coord(2:nm:3))/sum_mass
centr_z=sum(centr_coord(3:nm:3))/sum_mass
coord(3,1:nm:3)=coord(3,1:nm:3)-centr_x
coord(3,2:nm:3)=coord(3,2:nm:3)-centr_y
coord(3,3:nm:3)=coord(3,3:nm:3)-centr_z
!Выставляется в начало координат центр масс молекулы в той конфигурации, в которой происходил расчет Гессиана
!coord(3,10)=coord(3,10)+50.0
!inpres(:,:)=rotate_molecula(coord(2,:),coord(3,:),number_atoms,mass,gradient(:))
inpres(:,:)=rotate_molecula(coord(2,:),coord(3,:),number_atoms,mass,coord(2,:))
coord(2,:)=inpres(1,:)
!gradient(fin_state0,:)=inpres(2,:)
inpres(:,:)=rotate_molecula(coord(1,:),coord(2,:),number_atoms,mass,nacme(fin_state0,init_state0,:))
coord(1,:)=inpres(1,:)
nacme(fin_state0,init_state0,:)=inpres(2,:)
inpres(:,:)=rotate_molecula(coord_g(:),coord(2,:),number_atoms,mass,gradient(:))
gradient(:)=inpres(2,:)
!Конфигурации молекул поворачивают так, чтобы они начали удовлетворять условиям Эккарта.
!Сначала поворачивается конфигурация конечного состояния относительно конфигурации Гессиан-расчета.
!Потом поворачивается конфигурация начального состояния относительного конечного состояния.
!Вектор nacme поворачивается вместе с начальным состоянием. На те же углы.
print *, "---------------------------------------------------------------------------"
print *, " INTERMEDIATE RESULTs "
print *, "---------------------------------------------------------------------------"
print *, "Coordinate distorsions due to transfer between states:"
print *, " ATOM ATOMIC DISTORSIONS (BOHR)"
print *, " MASS dX dY dZ"
do i=1,nm,3
write (*, '(A10,F6.1,F20.10,F20.10,F20.10)') labels(i), mass(i)/1822.888, coord(2,i)-coord(1,i), &
coord(2,i+1)-coord(1,i+1), coord(2,i+2)-coord(1,i+2)
end do !Вывод смещений координат между начальным и конечными состояниями
call eignvalvec(mass, hess, number_atoms)!Расчет СВ и колебательных мод молекулы
!Выдает обратную матрицу СВ в переменной invec2(1:3*number_atoms,1:3*number_atoms) и моды в mode2(1:3*number_atoms)
omega=mode2
HRFs=HuangRhys(omega,invec2,mass,coord(1,:),coord(2,:),3*number_atoms) !Расчет факторов Хуанга-Риса
!HR_Q(1:nm)=sqrt(mass(1:nm))*(coord(2,1:nm)-coord(1,1:nm)) !!!Mark3
!HR_Q(1:nm)=matmul(invec2(1:nm,1:nm),HR_Q(1:nm)) !!!Mark4
HR_Q(1:nm)=(coord(2,1:nm)-coord(1,1:nm))
nbe(NumRotTrM+1:3*number_atoms)=(exp(omega(NumRotTrM+1:3*number_atoms)/kT)-1.0)**(-1) !Расчет распределения Больцмана по модам
!-------------------------------------
!Параметры для метода Гаусса
Er=sum(HRFs(NumRotTrM+1:3*number_atoms)*omega(NumRotTrM+1:3*number_atoms))
del_w=sqrt(sum(HRFs(NumRotTrM+1:3*number_atoms)*(omega(NumRotTrM+1:3*number_atoms)**2)*(2*nbe(NumRotTrM+1:3*number_atoms)+1)))
!-------------------------------------
!Параметры для метода Пекара
mmn=nm
do i=nm,NumRotTrM+1,-1
if (HRFs(i)>cutoff) mmn=i
end do !Поиск первой моды с ненулевым фактором Хуанга-Риса
step=omega(mmn)
delta=step*20 !Установка диапазона (в а.е.э.) при попадании в который, мода считается пропускающей
mask(NumRotTrM+1:3*number_atoms)=transfer((HRFs(NumRotTrM+1:3*number_atoms)>cutoff),mask(NumRotTrM+1:3*number_atoms))
w0=0.0
do i=NumRotTrM+1,nm
if (mask(i)>0) then
counter=counter+1
w0=w0+omega(i)
end if
end do
w0=w0/counter
sigma1=0.0
do k=NumRotTrM+1,3*number_atoms
sigma1=sigma1+HRFs(k)*(nbe(k)+1)*(w0-omega(k))
end do
sigma1s=0.0
do k=NumRotTrM+1,3*number_atoms
sigma1s=sigma1s+HRFs(k)*nbe(k)*(w0-omega(k))
end do
sigma0=0.0
do k=NumRotTrM+1,3*number_atoms
sigma0=sigma0+HRFs(k)*(nbe(k)+1)
end do
sigma0s=0.0
do k=NumRotTrM+1,3*number_atoms
sigma0s=sigma0s+HRFs(k)*nbe(k)
end do
HRFmin=HRFs(NumRotTrM+1); HRFmax=HRFs(NumRotTrM+1)
do k=NumRotTrM+2,3*number_atoms
if ((HRFs(k)<HRFmin) .and. (HRFs(k)>cutoff)) then
HRFmin=HRFs(k)
end if
if (HRFs(k)>HRFmax) then
HRFmax=HRFs(k)
end if
end do
if ((TypeOfDOS==3) .or. (TypeOfDOS==1)) then
Threshold=HRFmax+1.0
else if (TypeOfDOS==2) then
Threshold=ThresholdHRF
if (Threshold>HRFmax) then
print *, "Warning! Threshold is higher than the maximum Huang-Rhys facror. The Hybrid function degenerate into Gaussian"
else if (Threshold<HRFmin) then
print *, "Warning! The minimal Huang-Rhys facror is ",HRFmin
call write_error(1,25,"")
end if
end if
mask(NumRotTrM+1:3*number_atoms)=transfer(((omega(NumRotTrM+1:3*number_atoms) <=Eif+delta) .and. &
(HRFs(NumRotTrM+1:3*number_atoms)>cutoff)),mask(NumRotTrM+1:3*number_atoms))
if (symmetry) then
if (total_symmetry) then
mask5(NumRotTrM+1:3*number_atoms)=transfer(((omega(NumRotTrM+1:3*number_atoms) <=Eif+delta) .and. &
(HRFs(NumRotTrM+1:3*number_atoms)>cutoff) .and. (HRFs(NumRotTrM+1:3*number_atoms)<10.0)),&
mask5(NumRotTrM+1:3*number_atoms))
endif
else
mask5(NumRotTrM+1:3*number_atoms)=1
endif
!if (Threshold>=cutoff) then
mask4(NumRotTrM+1:3*number_atoms)=transfer(((omega(NumRotTrM+1:3*number_atoms) <=Eif+delta) .and. &
(HRFs(NumRotTrM+1:3*number_atoms)>Threshold)),mask(NumRotTrM+1:3*number_atoms))
!else
! mask4(NumRotTrM+1:3*number_atoms)=transfer(((omega(NumRotTrM+1:3*number_atoms) <=Eif+delta) .and. &
! (HRFs(NumRotTrM+1:3*number_atoms)>cutoff)),mask(NumRotTrM+1:3*number_atoms))
!endif
!!!Mark11start*************************************************
Nmax(NumRotTrM+1:3*number_atoms)=Eif/Omega(NumRotTrM+1:3*number_atoms)
!Максимальное число уровней для каждой моды, которое расчитывается так чтобы их энергия не была выше Eif
call found_area(HRFs,omega,NumRotTrM,7, cutoff2) !!!!!!!!!!!!!!found_area2
!Находится диапазон в котором будет происходить перебор КЧ колебательных мод.
!Перебор КЧ за пределами диапазона не имеет смысла.
Vsum=0.0 !Инициализация переменной для суммирования квадратов возмущений
FCF_value=0.0 !Инициализация переменной для суммирования факторов франка-Кондона
EndCycle=.false. !Инициализация флага остановки цикла перебора мод
mmn=1
do i=NumRotTrM+1,nm
if (mask(i)>0) mmn=i
end do !Поиск последней моды с ненулевым фактором Хуанга-Риса
mask=mask-mask4
Er=sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*omega(NumRotTrM+1:nm)*mask(NumRotTrM+1:nm))
del_w=sqrt(sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*(omega(NumRotTrM+1:nm)**2)*(2*nbe(NumRotTrM+1:nm)+1.0)*&
mask(NumRotTrM+1:nm)))
if (del_w==0.0) then
del_w=0.000091134
end if
if (res_mode/=2) then !Если ищется скорость конверсии, то найти неадибатические константы в пространстве нормальных координат
BB(1:nm,NumRotTrM+1:nm)=TRANSPOSE(invec2(NumRotTrM+1:3*nm,1:nm))
!Матрица B(i,j) для перехода между нормальными и декартовыми координатами
!i - декартовы координаты
!j - нормальные координаты
do k=1,nm
BB(k,NumRotTrM+1:nm)=sqrt(mass(k))*BB(k,NumRotTrM+1:nm) !Каждая строка умножается на соответствующий ей корень массы атома
FV(k)=nacme(fin_state0,init_state0,k)/mass(k) !!!Mark7 !отношение nacme коэффициента к массе, соответсвующего ему атом
GV(k)=gradient(k)/mass(k) !Отношение градиента в Декартовых координатах к массе атома
end do
SV(NumRotTrM+1:nm)=matmul(FV(1:nm),BB(1:nm,NumRotTrM+1:nm)) !!!Mark9 !неадибатические константы в пространстве нормальных координат
QV(NumRotTrM+1:nm)=matmul(GV(1:nm),BB(1:nm,NumRotTrM+1:nm)) !Градиент в нормальных координатах
mask3(1:3000)=0
ValForMask(NumRotTrM+1:nm)=abs(SV(NumRotTrM+1:nm))/sum(abs(SV(NumRotTrM+1:nm))) !Вклад моды в неадиабатического взаимодействие
mask3(NumRotTrM+1:nm)=transfer(ValForMask(NumRotTrM+1:nm)>cutoff3,mask3(NumRotTrM+1:nm)) !Маска, которая отрезает моды с вкладом в
!неадиабитическое взаимодействие меньше чем cutoof3
end if
HR_Q(NumRotTrM+1:nm)=matmul(HR_Q(1:nm),BB(1:nm,NumRotTrM+1:nm))
KFCF=0.0
Kgrad=0.0
Kalpha=0.0
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
if (grad_file/="") then
do i=NumRotTrM+1,nm
KFCF=KFCF+abs((omega(i)**2)*HR_Q(i))
Kgrad=Kgrad+abs(QV(i))
ksi(i)=QV(i)-(omega(i)**2)*HR_Q(i)
Kalpha=Kalpha+ksi(i)
print *, (omega(i)**2)*HR_Q(i), QV(i)
enddo
print *, "GAP", KFCF, Kgrad
ksi(1:3000)=ksi(1:3000)/Kalpha
GAP=abs(KFCF-Kgrad)/Max(KFCF,Kgrad)
endif
Nmax=nmaxc*mask4 !Максимальные значения, обрезанные по маски
Nmin=nminc*mask4 !Минимальные значения, обрезанные по маски
print *, ""
print *, "Characteristics of mode in transfer process:"
print *, "------------------------------------------------------------------------"
if (res_mode==1) then
print *, " Mode Frequency <f|d/dQ|i> Huang-Rhys F. Ksi "
print *, "------------------------------------------------------------------------"
do k=NumRotTrM+1,nm
write (*, '(I6,F13.2,E18.2,E18.2,E18.2)'), k, omega(k)*219474.09375, SV(k), HRFs(k), ksi(k)
end do !Ввывод таблицы с промежуточными параметрами для расчета скорости внутренней конверсии
else
print *, " Mode Frequency Huang-Rhys F. Ksi "
print *, "---------------------------------------------------------------------"
do k=NumRotTrM+1,nm
write (*, '(I6,F13.2,E18.2,E18.2)'), k, omega(k)*219474.09375, HRFs(k), ksi(k)
end do !Ввывод таблицы с промежуточными параметрами для расчета скорости интеркомбинационного перехода
end if
print *, "------------------------------------------------------------------------"
print *, "'Mode' is number of a vibronic mode,"
print *, "'Frequency' of mode this mode is in cm-1,"
if (res_mode==1) then
print *, "'<f|d/dQ|i>' non-adiabatic coupling in normal cordinates (atomic units),"
end if
print *, "------------------"
write (*,'(A5,F6.3)') "GAP =",GAP
!stop
if (GAP>0.1) then
print *, "Attention!!! GAP is larger than 0.1"
endif
print *, "------------------"
!Расчет начальный значений квантовый чисел
!Перебор идет сверху вниз!
residual=Eif+delta
do i=nm,NumRotTrM+1,-1
n(i)=floor(residual/omega(i))
if (Nmax(i)<n(i)) then
n(i)=Nmax(i)
end if
residual=residual-n(i)*omega(i)
end do
!Расчет значений промежуточных функций для различных квантовых чисел
do i=NumRotTrM+1,3*number_atoms
do j=1,20
UnMul(i,j)=under_mult(HRFs(i), j-1)
end do
end do
if (res_mode==1) then !Промежуточные функции, которые нужны только для
!расчета внутренней конверсии.
do i=NumRotTrM+1,3*number_atoms
do j=1,20
UnSum(i,j)=sec_func(j-1,HRFs(i),omega(i))
end do
end do
end if
call cpu_time(start_time) !Время старта расчета
print *, ""
print *, "Calculation is in progress..."
if (res_mode==1) then
!Начало расчета IC
!Цикл в котором происходит перебор квантовых чисел
if (symmetry .and. .not. total_symmetry) then
print *, "Energy sum for the i-th modes "
print *, "--------------------------------"
print *, " i (V_iv)^2 "
print *, "--------------------------------"
if (TypeOfDOS==2) then
do k=NumRotTrM+1,nm
EndCycle=.false.
mask4n=mask
mask4n(k)=0.0
!print '(100I1)', mask
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
!Vsum=0.0 !Инициализация переменной для суммирования квадратов возмущений
FCF_value=0.0 !Инициализация переменной для суммирования факторов франка-Кондона
EndCycle=.false. !Инициализация флага остановки цикла перебора мод
residual=Eif+delta
n=0
do i=nm,NumRotTrM+1,-1
n(i)=floor(residual/omega(i))
if (Nmax(i)<n(i)) then
n(i)=Nmax(i)
end if
residual=residual-n(i)*omega(i)
end do
do while (.not. EndCycle)
del_w2=sqrt(sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*(omega(NumRotTrM+1:nm)**2)*(2*nbe(NumRotTrM+1:nm)+1.0)*&!!!
mask4n(NumRotTrM+1:nm)))!!!
Er2=sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*omega(NumRotTrM+1:nm)*mask4n(NumRotTrM+1:nm))!!!
del_w2=sqrt(del_w2**2+2.0*kT*Esolv)
Er2=Er2+Esolv
Evib=sum(n(NumRotTrM+1:nm)*Omega(NumRotTrM+1:nm)*mask4(NumRotTrM+1:nm))
if ((Eif-delta<=Evib) .and. (0.0<=Evib)) then
!Вклад рассчитывается только в том случае, если энергии уровня попадает в разрешенный диапазон
FCF_value=FCF_value+(FCF(n, NumRotTrM, nm,mask4)**2)*exp(-((Eif-Evib-Er2)**2)/(2.0*(del_w2**2)))/del_w2
!print *, FCF_value
end if
targetc=NumRotTrM+1 !Номер квантового числа, которое обрабатывается в данном цикле
flag=.false. ! Флаг, который нужен для выхода из цикла, пересчитывающее значения квантового числа
do while (.not. flag)
n(targetc)=n(targetc)-1 !Уменьшаем значение квантового числа
if (n(targetc)<nmin(targetc)) then !Если КЧ опустилось ниже минимального значения, то переходим на следующее КЧ
targetc=targetc+1
else !Если не опустилось, то пересчитываем нижелещащие квантовые числа
residual=Eif+delta-sum(n(targetc:nm)*omega(targetc:nm))
if (residual<=0.0) residual=0.0
targetcc=targetc-1
do while (targetcc>NumRotTrM)
n(targetcc)=floor(residual/omega(targetcc))
if (Nmax(targetcc)<n(targetcc)) then
n(targetcc)=Nmax(targetcc)
end if
residual=residual-n(targetcc)*omega(targetcc)
if (residual<=0.0) residual=0.0
targetcc=targetcc-1
end do
Evib=sum(n(NumRotTrM+1:nm)*Omega(NumRotTrM+1:nm))
if ((Evib<Eif-delta) .or. (Evib<0.0)) then !Если энергия состояния ниже предела, то перейти к стартовому КЧ
targetc=NumRotTrM+1
else
flag=.true. !В противном случае выйти из цикла
end if
end if
if ((n(mmn)<nmin(mmn)) .or. (n(nm+1)<0)) then !Последнее значащае КЧ опустилось ниже минимума
flag=.true.!Законцить перебор КЧ
EndCycle=.true.
end if
end do
end do
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
if (mask3(k)>0) then
resultval=0.0
Vsum2add=(SV(k)**2)*omega(k)*FCF_value
Vsum=Vsum+Vsum2add
print *, k, Vsum2add
end if
end do
elseif (TypeOfDOS==3) then
!Вклад рассчитывается только в том случае, если энергии уровня попадает в разрешенный диапазон
do k=NumRotTrM+1,nm
mask4n=mask
mask4n(k)=0.0
del_w2=sqrt(sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*(omega(NumRotTrM+1:nm)**2)*(2*nbe(NumRotTrM+1:nm)+1.0)*&
mask4n(NumRotTrM+1:nm)))
Er=sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*omega(NumRotTrM+1:nm)*mask4n(NumRotTrM+1:nm))
del_w2=sqrt(del_w2**2+2.0*kT*Esolv)
Er=Er+Esolv
!Evib=sum(n(NumRotTrM+1:nm)*Omega(NumRotTrM+1:nm)*mask4n(NumRotTrM+1:nm))
Evib=sum(n(NumRotTrM+1:nm)*Omega(NumRotTrM+1:nm)*mask4(NumRotTrM+1:nm))
if (mask3(k)>0) then
resultval=0.0
Vsum2add=(SV(k)**2)*omega(k)*exp(-((Eif-Evib-Er)**2)/(2.0*(del_w2**2)))/del_w2
Vsum=Vsum+Vsum2add
print *, k, Vsum2add
end if
end do
elseif (TypeOfDOS==1) then
do k=NumRotTrM+1,nm
if (mask3(k)>0) then
if (Eif-omega(k)>0) then
resultval=0.0
HRFsm=HRFs; HRFsm(k)=0.0
omegam=omega; omegam(k)=0.0
nbem=nbe; nbem(k)=0.0
wr=real(wn_c(eif-omega(k),w0,sigma0,sigma0s,sigma1,sigma1s,0))
wi=aimag(wn_c(eif-omega(k),w0,sigma0,sigma0s,sigma1,sigma1s,0))
g1c=cmplx(1.0,1.0)
if (Eif-omega(k)>0.0) then
do while (abs(g1c)>0.0001)
g1c=g1fun(cmplx(wr,wi),HRFsm,omegam,nbem,Eif-omega(k),&
NumRotTrM,3*number_atoms,mask)
g1r=real(g1c)
g1i=aimag(g1c)
stepC=(abs(g1c)**(1/2))
if (stepC>0.01) stepC=0.01
wr=wr-stepC*g1r/sqrt(g1r**2.0+g1i**2.0)
wi=wi-stepC*g1i/sqrt(g1r**2.0+g1i**2.0)
end do
resultval=exp(gfun(cmplx(wr,wi),HRFsm,omegam,nbem,Eif-omega(k),NumRotTrM,&
3*number_atoms,mask))/g2fun(cmplx(wr,wi),HRFsm,omegam,nbem,Eif-omega(k),&
NumRotTrM,3*number_atoms,mask)
end if
else
mask4n=mask
mask4n(k)=0.0
del_w2=sqrt(sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*(omega(NumRotTrM+1:nm)**2)*&
(2*nbe(NumRotTrM+1:nm)+1.0)*mask4n(NumRotTrM+1:nm)))
Er=sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*omega(NumRotTrM+1:nm)*mask4n(NumRotTrM+1:nm))
!Evib=sum(n(NumRotTrM+1:nm)*Omega(NumRotTrM+1:nm)*mask4n(NumRotTrM+1:nm))
Evib=sum(n(NumRotTrM+1:nm)*Omega(NumRotTrM+1:nm)*mask4(NumRotTrM+1:nm))
resultval=exp(-((Eif-Evib-Er)**2)/(2.0*(del_w2**2)))/del_w2
endif
Vsum=Vsum+(SV(k)**2)*omega(k)*resultval
print *, k, real((SV(k)**2)*omega(k)*resultval)
end if
end do
end if
else !Расчет без учета симметрии
print *, "Energy sum for the i-th and v-th modes "
print *, "-------------------------------------------"
print *, " i v (V_iv)^2 "
print *, "-------------------------------------------"
Evib=sum(n(NumRotTrM+1:nm)*Omega(NumRotTrM+1:nm)*mask4(NumRotTrM+1:nm))
!Вклад рассчитывается только в том случае, если энергии уровня попадает в разрешенный диапазон
Vsum=0.0
if (TypeOfDOS==2) then
print *, "The Hybrid function is unavalible for IC calculation!"
stop
elseif (TypeOfDOS==3) then
do j=NumRotTrM+1,nm
if (mask5(j)>0) then
Vsum1=0.0
do v=j+1,nm
if (mask5(v)>0) then
HRFsm=HRFs; HRFsm(j)=0.0; HRFsm(v)=0.0
omegam=omega; omegam(j)=0.0; omegam(v)=0.0
nbem=nbe; nbem(j)=0.0; nbem(v)=0.0
Vsum2=0.0; Vsum2add=0.0
if (HRFs(j)<cutoff) then
minj=1; maxj=1; nj=1
elseif (HRFs(j)<10.0) then
minj=0; maxj=20; nj=0
else
minj=20; maxj=20; nj=0
endif
do while (((nj<2) .or. (Vsum2add>0.001*cutoff2*Vsum2)) .and. ((minj<=nj) .and. (nj<=maxj)))
Vsum3=0.0; Vsum3add=0.0
if (HRFs(v)<cutoff) then
minv=1; maxv=1; nv=1
elseif (HRFs(v)<10.0) then
minv=0; maxv=20; nv=0
else
minv=20; maxv=20; nv=0
endif
do while (((nv<2) .or. (Vsum3add>0.001*cutoff2*Vsum3)) .and. ((minv<=nv) .and. (nv<=maxv)))
mask4n=mask
mask4n(j)=0.0; mask4n(v)=0.0
del_w2=sqrt(sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*(omega(NumRotTrM+1:nm)**2)*(2*nbe(NumRotTrM+1:nm)+1)*&
mask4n(NumRotTrM+1:nm)))
Er=sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*omega(NumRotTrM+1:nm)*mask4n(NumRotTrM+1:nm))
del_w2=sqrt(del_w2**2+2.0*kT*Esolv)
Er=Er+Esolv
Vsum3add=abs(nv-HRFs(v))*(HRFs(v)**(nv-1))*sqrt(HRFs(v))*&
exp(-((Eif-omega(j)*nj-omega(v)*nv-Er)**2)/&
(2.0*(del_w2**2)))/(del_w2*difact(nv))
Vsum3=Vsum3+Vsum3add
nv=nv+1
enddo
Vsum2add=abs(nj-HRFs(j))*(HRFs(j)**(nj-1))*sqrt(HRFs(j))*Vsum3/difact(nj)
if (Vsum2add<0.0) then
print *, "Vsum2add", abs(nj-HRFs(j)),(HRFs(j)**(nj-1)),sqrt(HRFs(j))
print *, j, v, nj, nv, resultval,difact(nj)
stop
endif
Vsum2=Vsum2+Vsum2add
nj=nj+1
print *, j, j, Vsum2add
enddo
Vsum1=Vsum1+SV(v)*sqrt(omega(v))*exp(-HRFs(v))*Vsum2
endif
enddo
Vsum=Vsum+SV(j)*sqrt(omega(j))*exp(-HRFs(j))*Vsum1
endif
enddo
Vsum=2*Vsum
do j=NumRotTrM+1,nm
if (mask5(j)>0) then
Vsum2=0.0; Vsum2add=0.0
if (HRFs(j)<cutoff) then
minj=1; maxj=1; nj=1
elseif (HRFs(j)<10.0) then
minj=0; maxj=20; nj=0
else
minj=20; maxj=20; nj=0
endif
HRFsm=HRFs; HRFsm(j)=0.0
omegam=omega; omegam(j)=0.0
nbem=nbe; nbem(j)=0.0
do while (((nj<2) .or. (Vsum2add>0.001*cutoff2*Vsum2)) .and. ((minj<=nj) .and. (nj<=maxj)))
mask4n=mask; mask4n(j)=0.0
del_w2=sqrt(sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*(omega(NumRotTrM+1:nm)**2)*(2*nbe(NumRotTrM+1:nm)+1)*&
mask4n(NumRotTrM+1:nm)))
Er=sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*omega(NumRotTrM+1:nm)*mask4n(NumRotTrM+1:nm))
del_w2=sqrt(del_w2**2+2.0*kT*Esolv)
Er=Er+Esolv
Vsum2add=(UnMul(j,nj+1)**2)*exp(-((Eif-omega(j)*nj-Er)**2)/(2.0*(del_w2**2)))/del_w2
Vsum2=Vsum2+Vsum2add
nj=nj+1
end do
Vsum=Vsum+(SV(j)**2)*omega(j)*exp(-HRFs(j))*Vsum2
print *, j, j, (SV(j)**2)*omega(j)*exp(-HRFs(j))*Vsum2
endif
end do
elseif (TypeOfDOS==1) then
do j=NumRotTrM+1,nm
!do j=7,nm
if (mask5(j)>0) then
Vsum1=0.0
do v=j+1,nm
!do v=43,nm
if (mask5(v)>0) then
HRFsm=HRFs; HRFsm(j)=0.0; HRFsm(v)=0.0
omegam=omega; omegam(j)=0.0; omegam(v)=0.0
nbem=nbe; nbem(j)=0.0; nbem(v)=0.0
Vsum2=0.0; Vsum2add=0.0
if (HRFs(j)<cutoff) then
minj=1; maxj=1; nj=1
elseif (HRFs(j)<10.0) then
minj=0; maxj=20; nj=0
else
minj=20; maxj=20; nj=0
endif
do while (((nj<2) .or. (Vsum2add>0.001*cutoff2*Vsum2)) .and. ((minj<=nj) .and. (nj<=maxj)))
Vsum3=0.0; Vsum3add=0.0
if (HRFs(v)<cutoff) then
minv=1; maxv=1; nv=1
elseif (HRFs(v)<10.0) then
minv=0; maxv=20; nv=0
else
minv=20; maxv=20; nv=0
endif
do while (((nv<2) .or. (Vsum3add>0.001*cutoff2*Vsum3)) .and. ((minv<=nv) .and. (nv<=maxv)))
stepC=0.01
!nv=7 !!!!!!!!!!!################################################
if (eif-omega(j)*nj-omega(v)*nv>0.0) then
wr=real(wn_c(eif-omega(j)*nj-omega(v)*nv,w0,&
sigma0,sigma0s,sigma1,sigma1s,0))
!wr=-6010.0
wi=aimag(wn_c(eif-omega(j)*nj-omega(v)*nv,w0,&
sigma0,sigma0s,sigma1,sigma1s,0))
!print *, wr, wi
g1c=cmplx(1.0,1.0)
do while ((abs(g1c)>0.0001) .and. (sqrt(wr**2+wi**2)<2000.0))
g1c=g1fun(cmplx(wr,wi),HRFsm,omegam,nbem,Eif-omega(j)*nj-&
omega(v)*nv,NumRotTrM,3*number_atoms,mask)
!print *, g1c
!do i=7,nm
!print *, nbem(i),cmplx(wr,wi)*omega(i),exp(-cmplx(wr,wi)*omega(i))
!end do
g1r=real(g1c)
g1i=aimag(g1c)
stepC=sqrt(abs(g1c)**(1/2))
if (stepC>0.01) stepC=0.01
wr=wr-stepC*g1r/sqrt(g1r**2.0+g1i**2.0)
wi=wi-stepC*g1i/sqrt(g1r**2.0+g1i**2.0)
!print *, wr, wi, g1r, g1i
! print *, wr, wi, real(exp(gfun(cmplx(wr,wi),HRFsm,omegam,nbem,&
! Eif-omega(j)*nj-omega(v)*nv,NumRotTrM,3*number_atoms,mask)))/&
! sqrt(abs(g2fun(cmplx(wr,wi),HRFsm,omegam,nbem,&
! Eif-omega(j)*nj-omega(v)*nv,NumRotTrM,3*number_atoms,mask))*difact(nv))
end do
!stop
if (sqrt(wr**2+wi**2)<2000.0) then
resultval=exp(gfun(cmplx(wr,wi),HRFsm,omegam,nbem,&
Eif-omega(j)*nj-omega(v)*nv,NumRotTrM,3*number_atoms,mask))
else
resultval=0.0
print *, "resultval=0.0"
endif
g2v=g2fun(cmplx(wr,wi),HRFsm,omegam,nbem,&
Eif-omega(j)*nj-omega(v)*nv,NumRotTrM,3*number_atoms,mask)
Vsum3add=abs(nv-HRFs(v))*(HRFs(v)**(nv-1))*sqrt(HRFs(v))*real(resultval)/&
(sqrt(abs(g2v))*difact(nv))
Vsum3=Vsum3+Vsum3add
!print *, nj, nv, HRFs(j), HRFs(v), Vsum3add, resultval, difact(nj), difact(nj)
!stop
!print *, j, v, nj, nv, wr, wi, Vsum3add
!if (Vsum3add<0.0) then
!print *, "Vsum3add",abs(nv-HRFs(v)),HRFs(v)**(nv-1),sqrt(HRFs(v)),sqrt(HRFs(v))
!print *, j, v, nj, nv, resultval,difact(nv)
!stop
!end if
else
mask4n=mask
mask4n(j)=0.0; mask4n(v)=0.0
del_w2=sqrt(sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*(omega(NumRotTrM+1:nm)**2)*&
(2*nbe(NumRotTrM+1:nm)+1)*mask4n(NumRotTrM+1:nm)))
Er=sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*omega(NumRotTrM+1:nm)*mask4n(NumRotTrM+1:nm))
Vsum3add=abs(nv-HRFs(v))*(HRFs(v)**(nv-1))*sqrt(HRFs(v))*&
exp(-((Eif-omega(j)*nj-omega(v)*nv-Er)**2)/&
(2.0*(del_w2**2)))/(del_w2*difact(nv))
Vsum3=Vsum3+Vsum3add
end if
nv=nv+1
enddo
Vsum2add=abs(nj-HRFs(j))*(HRFs(j)**(nj-1))*sqrt(HRFs(j))*Vsum3/difact(nj)
!print *, nj, HRFs(j)**(nj-1), HRFs(j), Vsum3, difact(nj)
if (Vsum2add<0.0) then
print *, "Vsum2add", abs(nj-HRFs(j)),(HRFs(j)**(nj-1)),sqrt(HRFs(j))
print *, j, v, nj, nv, resultval,difact(nj)
!stop
endif
Vsum2=Vsum2+Vsum2add
nj=nj+1
enddo
Vsum1=Vsum1+SV(v)*sqrt(omega(v))*exp(-HRFs(v))*Vsum2
print *, j, v, SV(v)*sqrt(omega(v))*exp(-HRFs(v))*Vsum2
!stop
endif
enddo
Vsum=Vsum+SV(j)*sqrt(omega(j))*exp(-HRFs(j))*Vsum1
endif
enddo
Vsum=2*Vsum
print *, "Vsum=",Vsum
do j=NumRotTrM+1,nm
if (mask5(j)>0) then
Vsum2=0.0; Vsum2add=0.0
if (HRFs(j)<cutoff) then
minj=1; maxj=1; nj=1
elseif (HRFs(j)<10.0) then
minj=0; maxj=20; nj=0
else
minj=20; maxj=20; nj=0
endif
HRFsm=HRFs; HRFsm(j)=0.0
omegam=omega; omegam(j)=0.0
nbem=nbe; nbem(j)=0.0
do while (((nj<2) .or. (Vsum2add>0.001*cutoff2*Vsum2)) .and. ((minj<=nj) .and. (nj<=maxj)))
stepC=0.01
if (eif-omega(j)*nj>0.0) then
wr=real(wn_c(eif-omega(j)*nj,w0,sigma0,sigma0s,sigma1,sigma1s,0))
wi=aimag(wn_c(eif-omega(j)*nj,w0,sigma0,sigma0s,sigma1,sigma1s,0))
g1c=cmplx(1.0,1.0)
do while (abs(g1c)>0.0001)
g1c=g1fun(cmplx(wr,wi),HRFsm,omegam,nbem,Eif-omega(j)*nj,&
NumRotTrM,3*number_atoms,mask)
g1r=real(g1c)
g1i=aimag(g1c)
stepC=(abs(g1c)**(1/2))
if (stepC>0.01) stepC=0.01
wr=wr-stepC*g1r/sqrt(g1r**2.0+g1i**2.0)
wi=wi-stepC*g1i/sqrt(g1r**2.0+g1i**2.0)
end do
resultval=exp(gfun(cmplx(wr,wi),&
HRFsm,omegam,nbem,Eif-omega(j)*nj,NumRotTrM,3*number_atoms,mask))
g2v=g2fun(cmplx(wr,wi),&
HRFsm,omegam,nbem,Eif-omega(j)*nj,NumRotTrM,3*number_atoms,mask)
Vsum2add=((nj-HRFs(j))**2)*(HRFs(j)**(nj-1))*real(resultval)/&
(sqrt(abs(g2v))*difact(nj))
Vsum2=Vsum2+Vsum2add
else
Vsum2add=0.0
end if
nj=nj+1
end do
Vsum=Vsum+(SV(j)**2)*omega(j)*exp(-HRFs(j))*Vsum2
print *, j, j, (SV(j)**2)*omega(j)*exp(-HRFs(j))*Vsum2
endif
enddo
print *, "Vsum=",Vsum
endif
end if
!Конец расчета IC
elseif (res_mode==2) then
!Начало расчета ISC
if ((TypeOfDOS==2) .or. (TypeOfDOS==3)) then
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
!EndCycle=.false.
!mask4n=mask
!mask4n(k)=0.0
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
!Vsum=0.0 !Инициализация переменной для суммирования квадратов возмущений
FCF_value=0.0 !Инициализация переменной для суммирования факторов франка-Кондона
EndCycle=.false. !Инициализация флага остановки цикла перебора мод
residual=Eif+delta
do i=nm,NumRotTrM+1,-1
n(i)=floor(residual/omega(i))
if (Nmax(i)<n(i)) then
n(i)=Nmax(i)
end if
residual=residual-n(i)*omega(i)
end do
do while (.not. EndCycle)
del_w2=sqrt(sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*(omega(NumRotTrM+1:nm)**2)*(2*nbe(NumRotTrM+1:nm)+1.0)*&!!!
mask(NumRotTrM+1:nm)))!!!
Er2=sum(HRFs(NumRotTrM+1:nm)*omega(NumRotTrM+1:nm)*mask(NumRotTrM+1:nm))!!!
del_w2=sqrt(del_w2**2+2.0*kT*Esolv)
Er2=Er2+Esolv
Evib=sum(n(NumRotTrM+1:nm)*Omega(NumRotTrM+1:nm)*mask4(NumRotTrM+1:nm))
if ((Eif-delta<=Evib) .and. (0.0<=Evib)) then
!Вклад рассчитывается только в том случае, если энергии уровня попадает в разрешенный диапазон
FCF_value=FCF_value+(FCF(n, NumRotTrM, nm,mask4)**2)*exp(-((Eif-Evib-Er2)**2)/(2.0*(del_w2**2)))/del_w2
end if
targetc=NumRotTrM+1 !Номер квантового числа, которое обрабатывается в данном цикле
flag=.false. ! Флаг, который нужен для выхода из цикла, пересчитывающее значения квантового числа
do while (.not. flag)
n(targetc)=n(targetc)-1 !Уменьшаем значение квантового числа
if (n(targetc)<nmin(targetc)) then !Если КЧ опустилось ниже минимального значения, то переходим на следующее КЧ
targetc=targetc+1
else !Если не опустилось, то пересчитываем нижелещащие квантовые числа
residual=Eif+delta-sum(n(targetc:nm)*omega(targetc:nm))
if (residual<=0.0) residual=0.0
targetcc=targetc-1
do while (targetcc>NumRotTrM)
n(targetcc)=floor(residual/omega(targetcc))
if (Nmax(targetcc)<n(targetcc)) then
n(targetcc)=Nmax(targetcc)
end if
residual=residual-n(targetcc)*omega(targetcc)
if (residual<=0.0) residual=0.0
targetcc=targetcc-1
end do
Evib=sum(n(NumRotTrM+1:nm)*Omega(NumRotTrM+1:nm))
if ((Evib<Eif-delta) .or. (Evib<0.0)) then !Если энергия состояния ниже предела, то перейти к стартовому КЧ
targetc=NumRotTrM+1
else
flag=.true. !В противном случае выйти из цикла
end if
end if
if ((n(mmn)<nmin(mmn)) .or. (n(nm+1)<0)) then !Последнее значащае КЧ опустилось ниже минимума
flag=.true.!Законцить перебор КЧ
EndCycle=.true.
end if
end do
end do
resultval=FCF_value
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
else if (TypeOfDOS==1) then
stepC=0.1
resultval=0.0
wr=real(wn_c(eif,w0,sigma0,sigma0s,sigma1,sigma1s,0))
wi=aimag(wn_c(eif,w0,sigma0,sigma0s,sigma1,sigma1s,0))
g1c=cmplx(1.0,1.0)
do while (abs(g1c)>0.0001)
g1c=g1fun(cmplx(wr,wi),HRFs,omega,nbe,Eif,NumRotTrM,3*number_atoms,mask)
g1r=real(g1c)
g1i=aimag(g1c)
stepC=sqrt(abs(g1c)**(1/2))
if (stepC>0.01) stepC=0.01