后期及地图设定

二三章剧情简述：
第二章：轨道轰炸后乐童被带上天空城。渥太华联盟准备探究乐童以获取上合的技术。
渥太华联盟因为教皇肆意发动战争而爆发大规模骚乱，运输乐童的飞行器在波士顿天空城坠毁。
乐童在城中躲避联盟军队的搜捕，并且寻找传言中存在的“人类抵抗会“（上合间谍组织）「第二章游戏内容」。
乐童在最后联系上了人类抵抗会，在新利马城击败渥太华卫队通过H-BIU号回到地面。

第三章：乐童到了新耶路撒冷人提及的被禁止前往的锡安山，一个在地面上被上合组织长期引导并接受了现代科技的克隆人城市。
在城市中乐童了解到受损严重的上合联盟准备改造自己回到地面并最终击败渥太华联盟的计划。
乐童在城中搜索接近城市领导人改造人子豪的方法「第三章游戏内容」以此促成地面人与上合联盟的合作。
最终，促使合作成功的乐童在香港地下城用自己的力量带头击败了渥太华最后的入侵。

结局：上合联盟成功控制了地面，带领新人类（改造人）打败了渥太华联盟并炸毁了天空城。
乐童作为有着原罪（生于宇轩计划的实验）的英雄，在授勋典礼上被伪装成渥太华抵抗组织的上合特工击毙，成为了永远停留在史书上的“英雄“。


地图设定：
第一章城镇地图：人间模拟器中的新耶路撒冷城
循环设定：7日，世界末日重启
第一章章末地图：真正的新耶路撒冷城
第一章风格：16世纪欧洲城镇，有比现实中更宏大的国家机器，教堂更加宏伟

第二章城镇地图：波士顿天空城
循环设定：7日，安息日军队清扫抗议者休息后的城市
第二章章末地图：渥太华联盟首府新利马城
第二章风格：未来风的城市，有大量机器及现代主义设计

第三章城镇地图：锡安山
循环设定：5日，每5日巨大的机器将会把街道和城市还原成一开始的样子，以防渥太华的间谍留下记录
第三章章末地图：香港地下城
第三章风格：蒸汽朋克风格

设定补充：

第一章的模拟器以7天一循环是因为每一次灵魂收集实验必须在7天内完成以免被每周一次的渥太华联盟全地形扫描而发现。

第一章结束：第一次到地面进行真正的灵魂记忆收集的乐童（男主）在第七天准备返回时城镇被天罚计划发射的轨道炮击中。乐童重伤，被渥太华联盟运至天空城。

城镇守备力量可分为教会的正义巨像（不会EAWQA秒人的那种）和游弋在夜间的鬼魂。其实就是渥太华联盟维持城镇秩序的机器人和上合联盟在夜间巡逻的无人机。被二者任一击杀会直接失败。