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Molcas.F90
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Molcas.F90
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!# Copyright 2011,2012 Ignacio Fdez. Galván, M. Luz Sánchez, #
!# Aurora Muñoz Losa, M. Elena Martín, Manuel A. Aguilar #
!# #
!# This file is part of ASEP-MD. #
!# #
!# ASEP-MD is free software: you can redistribute it and/or modify it under #
!# the terms of the GNU General Public License as published by the Free #
!# Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) #
!# any later version. #
!# #
!# ASEP-MD is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY #
!# WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS #
!# FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU General Public License for more #
!# details. #
!# #
!# You should have received a copy of the GNU General Public License along #
!# with ASEP-MD. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>. #
!##############################################################################
MODULE Molcas
#ifndef LLL
#define LLL 256
#endif
USE DatosQM
CONTAINS
!LeerSalidaMolcas(Sal)
!ModificarMolcas(Ent,Sal,Der)
!-------------------------------------------------------------------------------
! Esta subrutina lee la salida del programa Molcas
!-------------------------------------------------------------------------------
! Sal: Fichero de salida de Molcas
! Coord: Matriz con las coordenadas para el ajuste de cargas
! Potencial: Matriz temporal para el potencial generado por el soluto
! PotQ: Vector temporal para el potencial generado por el disolvente
! Linea: La línea que se va leyendo
! Num: Número de átomos
! CI: Número de la raíz que se calcula
! UCar: Unidad para leer las cargas atómicas
! Error: Variable para controlar los errores
! Aux: Variable auxiliar para lectura
! i,j: Contadores
!-------------------------------------------------------------------------------
SUBROUTINE LeerSalidaMolcas(Sal)
USE Parametros
USE Unidades
USE Utilidades
USE UtilidadesFis
IMPLICIT NONE
INTEGER, INTENT(IN) :: Sal
DOUBLE PRECISION, DIMENSION(SIZE(MolQM,1),3) :: Coord
DOUBLE PRECISION, DIMENSION(:,:), ALLOCATABLE :: Potencial
DOUBLE PRECISION, DIMENSION(:), ALLOCATABLE :: PotQ
DOUBLE PRECISION :: Aux
CHARACTER(LEN=LLL) :: Linea
INTEGER :: Num,CI,UCar,Error,i,j
MultipQM=0
Num=SIZE(MolQM,1)
!Se inician las matrices del gradiente y hessiana
IF (ALLOCATED(GradQM)) DEALLOCATE(GradQM)
IF (ALLOCATED(HessQM)) DEALLOCATE(HessQM)
ALLOCATE(GradQM(3*Num),HessQM(3*Num,3*Num))
GradQM(:)=0.0D0
HessQM(:,:)=0.0D0
!Lee los datos del fichero de salida
Lectura: DO
READ(Sal,'(A)',IOSTAT=Error) Linea
IF (Error /= 0 ) EXIT
Linea=ADJUSTL(Linea)
!Carga del cálculo SCF
IF (Linea(1:16) == 'Molecular charge') THEN
READ(Linea(17:),*) Aux
CargaQM=INT(Aux)
!Carga total a partir de la población de Mulliken
ELSE IF (Linea(1:23) == 'Total charge') THEN
READ(Linea(25:),*) Aux
CargaQM=INT(Aux)
!Multiplicidad del cálculo SCF
ELSE IF (Linea(1:33) == 'Fermi aufbau procedure completed!') THEN
READ(Sal,'(A)') Linea
IF (ADJUSTL(Linea(1:13)) == 'nOcc(alpha)=') THEN
READ(Linea(14:),*) i
READ(Sal,'(A)') Linea
READ(Linea(14:),*) j
ELSE
READ(Linea(6:),*) i
j=i
END IF
MultipQM=ABS(i-j)+1
!Multiplicidad del cálculo RASSCF
ELSE IF (Linea(1:19) == 'Spin quantum number') THEN
READ(Linea(26:),*) Aux
MultipQM=INT(2*Aux)+1
!Raíz que se usa en un cálculo CI/RASSCF
ELSE IF ((Linea(1:12) == 'CI root used') .OR. &
(Linea(1:13) == 'CI roots used') .OR. &
(Linea(1:11) == 'Root passed')) THEN
READ(Linea(40:),*) CI
!Energía del cálculo SCF
ELSE IF (Linea(1:16) == 'Total SCF energy') THEN
READ(Linea(17:),*) EnergiaQM
!Energía del cálculo DFT
ELSE IF (Linea(1:19) == 'Total KS-DFT energy') THEN
READ(Linea(20:),*) EnergiaQM
!Energías del cálculo RASSCF
ELSE IF (Linea(1:23) == 'Final state energy(ies)') THEN
READ(Sal,*)
READ(Sal,*)
DO
READ(Sal,'(A)') Linea
IF (Error /= 0) CALL Mensaje('LeerSalidaMolcas',27,.TRUE.)
IF (ADJUSTL(Linea(1:17)) /= 'root number') EXIT
READ(Linea(18:21),*) i
IF (i == CI) READ(Linea(25:44),*) EnergiaQM
END DO
!Energía del cálculo MBPT2 o CASPT2
ELSE IF (Linea(1:13) == 'Total energy') THEN
IF (INDEX(Linea,'=') == 0) THEN
READ(Linea(14:),*) EnergiaQM
ELSE
READ(Linea(39:59),*) EnergiaQM
END IF
!Energía del cálculo CCSD
ELSE IF (Linea(1:21) == 'Correlation energy :') THEN
READ(Linea(22:),*) Aux
READ(Sal,'(A)') Linea
Linea=ADJUSTL(Linea)
READ(Linea(22:),*) EnergiaQM
EnergiaQM=EnergiaQM+Aux
!Energía del cálculo CCSD(T)
ELSE IF (Linea(1:9) == 'CCSD + T3') THEN
READ(Linea(18:),*) EnergiaQM
!Energía del cálculo MRCI
ELSE IF (Linea(1:17) == 'CORRECTED ENERGY:') THEN
READ(Linea(18:),*) EnergiaQM
!Propiedades (cargas, dipolo, potencial) de otras raíces RASSCF
ELSE IF (Linea(30:45) == 'for root number:') THEN
READ(Linea(46:),*) i
IF (i == CI) CYCLE
DO
READ(Sal,'(A)',IOSTAT=Error) Linea
IF (Error /= 0) CALL Mensaje('LeerSalidaMolcas',27,.TRUE.)
IF (INDEX(Linea,'Stop Module:') /= 0) EXIT
IF (Linea(36:51) == 'for root number:') THEN
BACKSPACE(Sal)
EXIT
END IF
END DO
!Saltar la salida de MCLR
ELSE IF (INDEX(Linea,'MOLCAS executing module MCLR') /= 0) THEN
DO
READ(Sal,'(A)',IOSTAT=Error) Linea
IF (Error /= 0) CALL Mensaje('LeerSalidaMolcas',27,.TRUE.)
IF (INDEX(Linea,'Stop Module:') /= 0) EXIT
END DO
!Momento dipolar
ELSE IF (Linea(1:13) == 'Dipole Moment') THEN
READ(Sal,*)
READ(Sal,100) DipoloQM(:)
DipoloQM(:)=DipoloQM(:)*DebyeAtomica
!Momento dipolar del cálculo MRCI
ELSE IF (Linea(1:18) == 'PROPERTY :MLTPL 1') THEN
READ(Linea(32:),*) i
DO
READ(Sal,'(A)',IOSTAT=Error) Linea
IF (Error /= 0) CALL Mensaje('LeerSalidaMolcas',27,.TRUE.)
IF (ADJUSTL(Linea(1:18)) == 'TOTAL:') EXIT
END DO
READ(Linea(19:),*) DipoloQM(i)
!??? DipoloQM(i)=DipoloQM(i)*DebyeAtomica
!Cargas de Mulliken
ELSE IF (Linea(1:16) == 'Mulliken charges') THEN
IF (TipoCargas /= 0) CYCLE !Mulliken
DO i=1,Num,12
DO
READ(Sal,'(A)',IOSTAT=Error) Linea
IF (Error /= 0) CALL Mensaje('LeerSalidaMolcas',27,.TRUE.)
IF (ADJUSTL(Linea(1:11)) == 'N-E') EXIT
IF (ADJUSTL(Linea(1:11)) == 'Charge') EXIT
IF (INDEX(Linea,'spin') /= 0) CYCLE Lectura
END DO
READ(Linea(12:),*) MolQM(i:MIN(i+11,Num))%q
END DO
!Gradiente analítico
ELSE IF (Linea(16:34) == 'Molecular gradients') THEN
DO
READ(Sal,'(A)',IOSTAT=Error) Linea
IF (Error /= 0) CALL Mensaje('LeerSalidaMolcas',27,.TRUE.)
IF (ADJUSTL(Linea) == 'Irreducible representation: a') EXIT
END DO
READ(Sal,*)
DO i=1,SIZE(GradQM,1)
READ(Sal,'(A)') Linea
READ(Linea(27:),*) GradQM(i)
END DO
!Gradiente numérico
ELSE IF (Linea(1:42) == 'MOLCAS executing module NUMERICAL_GRADIENT') THEN
DO
READ(Sal,'(A)',IOSTAT=Error) Linea
IF (Error /= 0 ) CALL Mensaje('LeerSalidaMolcas',27,.TRUE.)
Linea=ADJUSTL(Linea)
IF (Linea(1:19) == 'Numerical gradients') EXIT
END DO
IF (INDEX(Linea,'not implemented') /= 0) CYCLE
READ(Sal,*)
DO i=1,SIZE(GradQM,1)
READ(Sal,*)
READ(Sal,*) GradQM(i)
END DO
!Hessiana analítica
ELSE IF (Linea(1:14) == '*BEGIN HESSIAN') THEN
READ(Sal,*)
DO i=1,SIZE(HessQM,1)
READ(Sal,*)
READ(Sal,*) HessQM(:,i)
END DO
!Potencial electrostático
ELSE IF (Linea(1:19) == 'Electric Potential:') THEN
DO i=1,SIZE(DisolvQM,1)
DO
READ(Sal,'(A)',IOSTAT=Error) Linea
IF (Error /= 0) CALL Mensaje('LeerSalidaMolcas',27,.TRUE.)
IF (ADJUSTL(Linea(1:20)) == 'Total') EXIT
END DO
READ(Linea(21:),*) DisolvQM(i,5)
END DO
DO i=1,SIZE(PotQM,1)
DO
READ(Sal,'(A)',IOSTAT=Error) Linea
IF (Error /= 0) CALL Mensaje('LeerSalidaMolcas',27,.TRUE.)
IF (ADJUSTL(Linea(1:20)) == 'Total') EXIT
END DO
READ(Linea(21:),*) PotQM(i,4)
END DO
ELSE IF (Linea(1:20) == 'Non-zero return code') THEN
CALL Mensaje('LeerSalidaMolcas',28,.TRUE.)
END IF
END DO Lectura
!Si las cargas son ajustadas al potencial, se calculan
IF (TipoCargas == 2) THEN
IF (SIZE(DisolvQM,1)+SIZE(PotQM,1) > 0) THEN
!Se crea una matriz temporal con el potencial conjunto de DisolvQM y PotQM
ALLOCATE(Potencial(SIZE(DisolvQM,1)+SIZE(PotQM,1),4))
Potencial(1:SIZE(DisolvQM,1),1:3)=DisolvQM(:,1:3)
Potencial(1:SIZE(DisolvQM,1),4)=DisolvQM(:,5)
Potencial(SIZE(DisolvQM,1)+1:,:)=PotQM(:,:)
Coord(:,1)=MolQM(:)%pos(1)
Coord(:,2)=MolQM(:)%pos(2)
Coord(:,3)=MolQM(:)%pos(3)
IF (SIZE(DisolvQM,1) > 0) THEN
ALLOCATE(PotQ(SIZE(MolQM)))
CALL PotencialCargas(DisolvQM(:,1:4),Coord,PotQ)
CALL AjusteCargas(Coord,Potencial,DBLE(CargaQM),MolQM(:)%q, &
PotQ=PotQ,Energia=SUM(DisolvQM(:,4)*DisolvQM(:,5)))
DEALLOCATE(PotQ)
ELSE
CALL AjusteCargas(Coord,Potencial,DBLE(CargaQM),MolQM(:)%q)
END IF
DEALLOCATE(Potencial)
ELSE
!Si no hay potencial externo para ajustar, se dejan las cargas originales
CALL Mensaje('LeerSalidaMolcas',16,.FALSE.)
END IF
END IF
!O se leen de un fichero externo
IF (TipoCargas == 3) THEN
UCar=NuevaUnidad()
OPEN(UCar,FILE=TRIM(FicheroCargas),STATUS='OLD',ACTION='READ')
READ(UCar,*) MolQM(:)%q
CLOSE(UCar)
END IF
!Se igualan las cargas equivalentes para el Moldy
IF (ProgramaMM == 1) CALL IgualarCargas(MolQM(:)%id,MolQM(:)%q)
100 FORMAT(3(17X,F10.4))
END SUBROUTINE LeerSalidaMolcas
!-------------------------------------------------------------------------------
! Esta subrutina modifica la entrada de Molcas para incluir la geometría del
! soluto, las cargas que representan al disolvente, etc.
!-------------------------------------------------------------------------------
! Ent: Fichero de entrada (plantilla)
! Sal: Fichero de salida (entrada de Molcas)
! Der: Orden de la derivada de la energía que se quiere calcular
! Car: Fichero de cargas externas (opcional)
! Linea: La línea que se va leyendo
! FichTemp: Nombre del fichero donde se escriben las cargas externas
! Error: Variable para controlar los errores
! i: Contador
!-------------------------------------------------------------------------------
SUBROUTINE ModificarMolcas(Ent,Sal,Der,Car)
USE Unidades
IMPLICIT NONE
INTEGER, INTENT(IN) :: Ent,Sal,Der
INTEGER, INTENT(IN), OPTIONAL :: Car
CHARACTER(LEN=LLL) :: Linea,FichTemp
INTEGER :: Error,i
!Copia línea a línea, sustituyendo:
! ###(G)### -> geometría de la molécula
! ###(F)### -> cálculo de derivadas
! ###(C)### -> cargas externas
! ###(P)### -> puntos donde se calcula el potencial
DO
READ(Ent,'(A)',IOSTAT=Error) Linea
IF (Error /= 0) EXIT
SELECT CASE (TRIM(ADJUSTL(Linea)))
CASE ('###(G)###')
WRITE(Sal,'(A)') ' NoSymm'
WRITE(Sal,*) SIZE(MolQM,1)
WRITE(Sal,*)
DO i=1,SIZE(MolQM,1)
WRITE(Sal,100) Simbolo(MolQM(i)%z),MolQM(i)%pos(:)/AngstromAtomica
END DO
CASE ('###(F)###')
SELECT CASE (Der)
CASE (1)
WRITE(Sal,'(A)') '&ALASKA &END'
WRITE(Sal,'(A)') 'End of input'
CASE (2)
WRITE(Sal,'(A)') '&ALASKA &END'
WRITE(Sal,'(A)') 'End of input'
WRITE(Sal,'(A)')
WRITE(Sal,'(A)') '&MCKINLEY &END'
WRITE(Sal,'(A)') 'End of input'
CASE DEFAULT
END SELECT
CASE ('###(C)###')
IF (SIZE(DisolvQM,1) > 0) THEN
WRITE(Sal,'(A)') ' XField'
IF (PRESENT(Car)) THEN
WRITE(Car,101) SIZE(DisolvQM,1), 1
DO i=1,SIZE(DisolvQM,1)
WRITE(Car,102) DisolvQM(i,1:4)
END DO
INQUIRE(Car,NAME=FichTemp)
WRITE(Sal,'(A)') ' @$MOLCAS_SUBMIT_PWD/'//TRIM(FichTemp)
ELSE
WRITE(Sal,101) SIZE(DisolvQM,1), 1
DO i=1,SIZE(DisolvQM,1)
WRITE(Sal,102) DisolvQM(i,1:4)
END DO
END IF
END IF
CASE ('###(P)###')
IF (SIZE(DisolvQM,1)+SIZE(PotQM,1) > 0) THEN
WRITE(Sal,'(A)') ' EPot'
WRITE(Sal,101) SIZE(DisolvQM,1)+SIZE(PotQM,1)
DO i=1,SIZE(DisolvQM,1)
WRITE(Sal,102) DisolvQM(i,1:3)
END DO
DO i=1,SIZE(PotQM,1)
WRITE(Sal,102) PotQM(i,1:3)
END DO
END IF
CASE DEFAULT
WRITE(Sal,'(A)') TRIM(Linea)
END SELECT
END DO
100 FORMAT (2X,A2,3(1X,F19.12))
101 FORMAT (3X,5(1X,I6))
102 FORMAT (3X,4(1X,F19.12),' 0.0 0.0 0.0')
END SUBROUTINE ModificarMolcas
END MODULE Molcas