-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
pdb_parser.pyi
43 lines (33 loc) · 1.29 KB
/
pdb_parser.pyi
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
class Atom:
"""Klasa Atom reprezentuje pojedynczy atom struktury cząsteczki."""
name: str
pos_x: float
pos_y: float
pos_z: float
def __init__(self, name: str, pos_x: float, pos_y: float, pos_z: float) -> Atom: ...
def __repr__(self) -> str: ...
class Residue:
"""Klasa Residue reprezentuje pojedynczy aminokwas struktury."""
name: str
sequence_number: int
atoms: list[Atom]
def __init__(self, name: str, sequence_number: int, atoms: list[Atom]) -> Residue: ...
def __repr__(self) -> str: ...
class Chain:
"""Klasa Chain reprezentuje pojedynczy łańcych struktury."""
name: str
residues: list[Residue]
def __init__(self, name: str, residues: list[Residue]) -> Chain: ...
def __repr__(self) -> str: ...
def __len__(self) -> int:
"""Zwraca długość łańcucha."""
def get_sequence(self) -> list[str]:
"""Zwraca sekwencję aminokwasów łańcucha."""
class Structure:
"""Klasa Structure reprezentuje całą strukturę."""
name: str
chains: list[Chain]
def __init__(self, file_path: str) -> Structure: ...
def __repr__(self) -> str: ...
def dump_to_json(self) -> str:
"""Wykonuje zrzut struktury do formatu json (w postaci tekstowej)."""