همانطور که می دانید ما دو نوع جذب فیزیکی و شیمیایی داریم که جذب فیزیکی نوعی فرایند جذب است که در آن نیروهای مؤثر، نیروهای بین‌مولکولی (واندروالس) بوده و در اثر این فرایند جذب، تغییر محسوسی درالگوی اوربیتال الکترونی اتم‌های درگیر به وجود نمی‌آید. این نوع جذب دارای انرژی فعال‌سازی نیست و انرژی آزاد شده در طی آن در مقایسه با جذب شیمیایی کمتر است.
برای اجرای نمونه واندروالس، شما باید این روش را دنبال کنید:
در ابتدای کار برای اجرای شبیه سازی این نوع خاص از اجرا -VDW-DF - نیاز به تولید"vdW_kernel_table"، در فایل شبه پتانسیل است که یک بار تولید و در تمام محاسبات از آن استفاده می‌کنند. برای تولید vdW_kernel_table کافی است فایل generate-vdw-kemel را مطابق شکل 82 به فایل شبه پتانسیل برده و در آنجا مطابق شکل 83 اجرا کنیم.
شکل 82 مسیر تولید vdW_kernel_table
شکل 83 دستور تولید vdW_kernel_table در ترمینال
2- گام بعدی ویرایش "environment_variables" از فایل اصلی دایرکتوری اسپرسو، اضافه کردن input-dft مطابق شکل 84 در قسمت سیستم برنامه است. توجه داشته باشید کلیه input هایی که می‌توانید استفاده کنید درفایل funct-f90 مطابق شکل 85 قرار دارد و استفاده از شبه پتانسیل GGA مناسب تر است.
&SYSTEM
ibrav = 4
ceiidm(1)=4.6304,
celldm(3)=7,
nbnd=8,
nat=2,
ntyp=1,
ecutwfc=55,
ecutrho=550,
occupations='smearing',
degauss=0.01,
smearing='gaussian',
input_dft='vdw-df2-b86r',
شکل 84 ویرایش ورودی واندروالس
شکل 85 مسیر فایل funct-f90
اگر به مثال های بیشتری نیاز داشتید می‌توانید از مثال های خود اسپرسو از vdw-df-example مطابق شکل 86 استفاده کنید.
شکل 86 مثال های اجرایی واندروالس
خروجی واندر والس
در خروجی برنامه به سه خط توجه ویژه نمایید.
1- مطابق شکل 87 ، چاپ خط 21 باید لحاظ شود.
2- مطابق شکل 88، total energr , xc و برخی دیگر از پارامتر ها نسبت به حالتی که واندروالس ندارد باید تغییر کند.
15 Current dimensions of program PWSCF are:
16 Max number of different atomic species (ntypx) = 10
17 Max number of k-points (npk) = 40000
18 Max angular momentum in pseudopotentials (lmaxx) = 3
19
20 IMPORTANT: XC functional enforced from input :
21 Exchange-correlation = VDW-DF2-B86R ( 1 4 26 0 2 0 )
22 Any further DFT definition will be discarded
23 Please, verify this is what you really want
شکل 87 قسمتی از خروجی واندروالس
358! total energy = -22.53912642 Ry
359 Harris-Foulkes estimate = -22.53912596 Ry
360 estimated scf accuracy < 0.00000052 Ry
361
362 The total energy is the sum of the following terms:
363
364 one-electron contribution = -187.82227925 Ry
365 hartree contribution = 95.07064481 Ry
366 xc contribution = -6.91958108 Ry
367 ewald contribution = 77.13271098 Ry
368 smearing contrib. (-TS) = -0.00062188 Ry
شکل 88 انرژی کل خروجی واندر والس