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<!DOCTYPE html>
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" lang="" xml:lang="">
<head>
<title>Introducción a Bookdown</title>
<meta charset="utf-8" />
<meta name="author" content="Andrea Vargas" />
<link href="libs/remark-css/kunoichi.css" rel="stylesheet" />
<link href="libs/remark-css/ninjutsu.css" rel="stylesheet" />
</head>
<body>
<textarea id="source">
class: center, middle, inverse, title-slide
# Introducción a Bookdown
## RLadies San José CR
### Andrea Vargas
### Setiembre 2019
---
class: center, middle
# ¿Qué es bookdown?
---
class: middle center bg-main1
## Es una herramienta simple para crear libros utilizando R-RStudio
---
## Estructura básica de bookdown
<br>
### - Múltiples documentos de RMarkdown
<br>
### - Imágenes
<br>
### - HTML: Shinny apps o HTML widgets
<br>
### - Referencias de texto, figuras, ecuaciones, etc.
---
class: split-33 with-thick-border
.column.bg-main1[.content.vmiddle[
# Primero instalemos bookdown
]]
.column[.content[
## Puede solamente escribir:
```{}
---
install.packages("bookdown")
---
```
## O descargar la versión en desarrollo desde GitHub
```{}
devtools::install_github('rstudio/bookdown')
```
]]
---
class: bg-main1 split-30 hide-slide-number
.column.bg-main3[
]
.column.slide-in-right[
.sliderbox.bg-main2.vmiddle[
.font5[Creemos un libro]
]]
---
class: middle bg-main1
## 1. Abran un nuevo proyecto en RStudio
<br>
## 2. Book project using bookdown
</br>
## 3. Nombren su libro y decidan la ubicación de su proyecto
---
class: split-three white center
.row.bg-main1[.content.vmiddle[
# ¿Les aparecieros .yellow[muchos] archivos cierto?
]]
.row.bg-main2[.content.vmiddle[
# No se preocupen:
]]
.row.bg-main3[.content.vmiddle[
# .light-blue[bookdown] crea algunos archivos para guiarnos y otros necesarios para el libro
]]
---
#Archivos
```{}
directory/
├── .Rproj.user
├── book.Rproj
├── 01-intro.Rmd
├── 02-literature.Rmd
├── 03-method.Rmd
├── 04-application.Rmd
├── 05-summary.Rmd
├── 06-references.Rmd
├── README.md
├── _bookdown.yml
├── _output.yml
├── book.bib
├── index.Rmd # YAML + Chapter 1
├── preamble.tex
└── style.css
```
---
class: bg-main1 center middle hide-slide-number
.reveal-text.bg-main2[.pad1[
.font4[Rendericemos el libro]
]]
---
class: inverse, center, middle
#NO "KNITEEN"
---
class: bg-main2 center middle
# Hay tres opciones:
## 1. Addins -> BOOKDOWN: Preview Book
## 2. Build -> Build Book
## 3. bookdown::render_book('index.Rmd')
---
class: bg-main3 middle
#Noten que se crearon 3 archivos nuevos
```{}
├── _book
├── _bookdown_files
└── packages.bib
```
---
class: bg-main1
<br>
#Estructura
<br>
## - Prefacio: index.Rmd
## - Cuerpo: archivos .Rmd
## - Publicación: _bookdown.yml y _output.yml
---
class: bg-main3
.reveal-text.bg-main2[.pad1[
.font4[index.Rmd]
]]
### Aquí pueden controlar aspectos importantes como el título, subtítulo, autor, fecha, descripción, entre otros.
```{}
---
title: "A Minimal Book Example"
author: "Yihui Xie"
date: "2019-01-16"
site: bookdown::bookdown_site
documentclass: book
bibliography: [book.bib, packages.bib]
biblio-style: apalike
link-citations: yes
description: "This is a minimal example..."
---
```
---
class: bg-main2
.reveal-text.bg-main3[.pad1[
.font4[Cuerpo: .Rmd]
]]
## En nuestro caso:
```{}
1. index.Rmd
2. 01-intro
3. 02-literature
4. 03-03-method
5. 04-application
6. 05-summary
7. 06-references
```
---
class: split-two white
.column.bg-main1[.content[
# Etiquetas y referencias
<br>
index.Rmd
```{}
# Prerequisites {-#pre}
This is a _sample_ book written in **Markdown**.
```
01-intro.Rmd
```{}
# Introduction {#intro}
Next we review the [literature](#lit)...
```
02-literature.Rmd
```{}
# Literature {#lit}
Following Chapter \@ref(intro),...
```
]]
.column.bg-main2[.content[
# Resultado
<br><br>
# Prerequisites
This is a _sample_ book written in **Markdown**.
<br><br><br><br>
# Introduction
Next we review the [literature](#lit)...
<br><br><br><br>
# Literature
Following Chapter 1,...
]]
---
class: bg-main3
# Figuras
```{}
'''{r graf1, fig.cap='Grafico'}
par(mar = c(4, 4, .1, .1))
plot(pressure, type = 'b', pch = 19)
'''
```
<div class="figure">
<img src="intro-bookdown_files/figure-html/unnamed-chunk-1-1.png" alt="Fig.1:Grafico" width="200px" />
<p class="caption">Fig.1:Grafico</p>
</div>
---
# Referencias figuras
```{}
See Figure \@ref(fig:graf1).
```
<br>
See Figure 1
<br><br><br><br><br><br>
Otras opcioness: \@ref(tab:tabla1), \@ref(eq:ecuacion1), \@ref(thm:teorema1)
---
class: bg-main2 center middle
.reveal-text.bg-main3[.pad1[
.font3[Ahora es su turno, editen los capítulos y utilicen algunos de los elementos mencionados]
]]
---
class: bg-main1
# Existen capítulos, subcapítulos y "partes"
### Ya ustedes tienen capítulos y subcapítulos. Ahora veamos las partes:
En 01-intro.Rmd escriban:
```{}
# (PART) Act one {-}
# Introduction
```
En 03-methods.Rmd escriban:
```{}
# (PART) Act two {-}
# Methods
```
Si no quieren que se enumeren las partes:
```{}
# (PART\*) Act one {-}
```
---
class: bg-main3
.reveal-text.bg-main1[.pad1[
.font3[Apéndice]
]]
## Son las últimas palabras de su libro
En 05-summary.Rmd:
```{}
# (APPENDIX) Other stuff {-}
# Final Words
```
---
class: bg-main2
.reveal-text.bg-main3[.pad1[
.font2[Estilo]
]]
Se puede hacer con css si su formato final es .html. También hay opciones predeterminadas:
- bookdown::gitbook es el default
- bookdown::html_book
- bookdown::pdf_book
- bookdown::tufte_html_book
- bookdown::tufte_book2
En el caso de html_book pueden cambiarle además el estilo:
- theme: default
- theme: cerulean
- theme: journal
- theme: flatly
- theme: darkly
- theme: readable
- theme: spacelab
- theme: united
- theme: cosmo
- theme: lumen
- theme: paper
- theme: sandstone
- theme: simplex
- theme: yeti
---
class: bg-main1 center middle
.reveal-text.bg-main2[.pad1[
.font4[Algunos detalles importantes]
]]
---
class: split-two white
.column.bg-main1[.content[
# Recodemos un poco de syntax de .yellow[Markdown]
<br>
## Títulos
```{}
# Título de primer nivel
## Título de segundo nivel
### Título de tercer nivel
```
# Título de primer nivel
## Título de segundo nivel
### Título de tercer nivel
]]
.column.bg-main2[.content.vmiddle[
## Listas
```{}
Pueden empezar con (*, - o +)
y pueden identarse
- item
- item
- item
- item
- item
```
- item
- item
- item
- item
- item
]]
---
class: middle bg-main1
#LateX
## Algunos ejemplos
```{}
$f(k) = p^{k} (1-p)^{1-k}$
$$f(k) = p^{k} (1-p)^{1-k}$$
```
`\(f(k) = p^{k} (1-p)^{1-k}\)`
`$$f(k) = p^{k} (1-p)^{1-k}$$`
```{}
$$\begin{pmatrix}
\alpha & \beta\\
\gamma & \delta
\end{pmatrix}$$
```
`$$\begin{pmatrix}
\alpha & \beta\\
\gamma & \delta
\end{pmatrix}$$`
---
<br><br><br><br>
### Si quieren más información sobre bookdown vayan al <a href="https://bookdown.org/yihui/bookdown/">tutorial completo de bookdown</a> creado por Yihui Xie
---
# ¡Muchas gracias!
### Sígannos en Instagram: <a href="https://www.instagram.com/rladies_sjcr/">@rladies_sjcr</a>
### y en Twitter: <a href="https://twitter.com/RladiesCR">@RladiesCR</a>
### Búsquennos en Facebook: <a href="https://www.facebook.com/R-Ladies-San-José-CR-113831192660935/?ref=bookmarks">R-Ladies San José CR</a>
---
class: bg-main1 center middle
### Si tienen comentarios acerca del taller o sobre temas para futuras reuniones también nos pueden escribir al correo:
### sanjosecr@rladies.org
---
## ¡Las esperamos ver en la próxima reunión!
---
</textarea>
<style data-target="print-only">@media screen {.remark-slide-container{display:block;}.remark-slide-scaler{box-shadow:none;}}</style>
<script src="https://remarkjs.com/downloads/remark-latest.min.js"></script>
<script>var slideshow = remark.create({
"highlightStyle": "github",
"highlightLines": true,
"countIncrementalSlides": false
});
if (window.HTMLWidgets) slideshow.on('afterShowSlide', function (slide) {
window.dispatchEvent(new Event('resize'));
});
(function(d) {
var s = d.createElement("style"), r = d.querySelector(".remark-slide-scaler");
if (!r) return;
s.type = "text/css"; s.innerHTML = "@page {size: " + r.style.width + " " + r.style.height +"; }";
d.head.appendChild(s);
})(document);
(function(d) {
var el = d.getElementsByClassName("remark-slides-area");
if (!el) return;
var slide, slides = slideshow.getSlides(), els = el[0].children;
for (var i = 1; i < slides.length; i++) {
slide = slides[i];
if (slide.properties.continued === "true" || slide.properties.count === "false") {
els[i - 1].className += ' has-continuation';
}
}
var s = d.createElement("style");
s.type = "text/css"; s.innerHTML = "@media print { .has-continuation { display: none; } }";
d.head.appendChild(s);
})(document);
// delete the temporary CSS (for displaying all slides initially) when the user
// starts to view slides
(function() {
var deleted = false;
slideshow.on('beforeShowSlide', function(slide) {
if (deleted) return;
var sheets = document.styleSheets, node;
for (var i = 0; i < sheets.length; i++) {
node = sheets[i].ownerNode;
if (node.dataset["target"] !== "print-only") continue;
node.parentNode.removeChild(node);
}
deleted = true;
});
})();</script>
<script>
(function() {
var links = document.getElementsByTagName('a');
for (var i = 0; i < links.length; i++) {
if (/^(https?:)?\/\//.test(links[i].getAttribute('href'))) {
links[i].target = '_blank';
}
}
})();
</script>
<script>
slideshow._releaseMath = function(el) {
var i, text, code, codes = el.getElementsByTagName('code');
for (i = 0; i < codes.length;) {
code = codes[i];
if (code.parentNode.tagName !== 'PRE' && code.childElementCount === 0) {
text = code.textContent;
if (/^\\\((.|\s)+\\\)$/.test(text) || /^\\\[(.|\s)+\\\]$/.test(text) ||
/^\$\$(.|\s)+\$\$$/.test(text) ||
/^\\begin\{([^}]+)\}(.|\s)+\\end\{[^}]+\}$/.test(text)) {
code.outerHTML = code.innerHTML; // remove <code></code>
continue;
}
}
i++;
}
};
slideshow._releaseMath(document);
</script>
<!-- dynamically load mathjax for compatibility with self-contained -->
<script>
(function () {
var script = document.createElement('script');
script.type = 'text/javascript';
script.src = 'https://mathjax.rstudio.com/latest/MathJax.js?config=TeX-MML-AM_CHTML';
if (location.protocol !== 'file:' && /^https?:/.test(script.src))
script.src = script.src.replace(/^https?:/, '');
document.getElementsByTagName('head')[0].appendChild(script);
})();
</script>
</body>
</html>