-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
Copy pathUtilityClasses.py
517 lines (404 loc) · 17.7 KB
/
UtilityClasses.py
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
import random
import Utils
import Constants
import math
"""
Набор вспомогательных классов, используемых этой программой.
Здесь описаны классы: Data, Cluster, Row, Column, Point
"""
class Data:
""" Объекты этого класса представляют собой табличный набор данных.
Кластеры оперируют объектами типа Data.
"""
def __init__(self, columns, rows=None):
""" Конструктор класса Data
Заполняет колонки, имена колонок, строки
:param columns: список объектов Column
:param rows: список объектов Row
"""
self._columns = columns
# TODO: долгое чтение разных массивов
if rows is None:
self._rows = []
for i, element in enumerate(self._columns[0]): # i - это строка
rowArray = []
for j in range(0, len(self._columns)): # j - это колонка
rowArray.append(self._columns[j][i])
self._rows.append(Row(i, rowArray))
else:
self._rows = rows
self._rowCount = len(self._rows)
self._columnCount = len(self._columns)
self._columnNames = []
for column in self._columns:
self._columnNames.append(column.getName())
def __getitem__(self, index):
return self._rows[index]
def __setitem__(self, index, value):
self._rows[index] = value
def __delitem__(self, index):
del self._rows[index]
# len на Data возвращает количество строк
def __len__(self):
return len(self._rows)
def remove(self, item):
self._rows.remove(item)
def rowCount(self):
return self._rowCount
def getColumns(self):
return self._columns
def addColumns(self, c_to_add,c_name):
self._columns.append(c_to_add)
self._columnNames.append(c_name)
self._columnCount = self._columnCount+1
# adjust rows
self._rows = []
for i, element in enumerate(self._columns[0]): #i - это строка
rowArray = []
for j in range (0, len(self._columns)): #j - это колонка
rowArray.append(self._columns[j][i])
self._rows.append(Row(i, rowArray))
self._rowCount = len(self._rows)
def columnCount(self):
return self._columnCount
def getColumnNames(self):
return self._columnNames
def getSignificanceFactors(self):
significancefactors = []
for column in self._columns:
if column.checkSignificance(): #TODO сделать нормально - еще на стадии приема данных проставлять 0 в вес незначимых колонок
significancefactors.append(column.getWeight())
else:
significancefactors.append(0)
return significancefactors
def getSignificantColumns(self):
significantcolumns = []
for column in self._columns:
if column.checkSignificance():
significantcolumns.append(column)
return significantcolumns
def significantColumnCount(self):
return len(self.getSignificantColumns())
def getSignificantColumnNames(self):
significantColumnNames = []
for column in self.getSignificantColumns():
significantColumnNames.append(column.getName())
return significantColumnNames
def getNameOfColumn(self, columnindex):
return self._columnNames[columnindex]
def getRowsByIndexSet(self, indexSet):
rows = []
for i in indexSet:
rows.append(self._rows[i])
return rows
def addRow(self, row):
self._rows.append(row)
for i, column in enumerate(self._columns):
column.append(row[i])
def replaceData(self, rows):
for i, row in enumerate(rows):
self._rows[i] = Row(i, row)
for j, element in enumerate(row):
self._columns[j][i] = element
@staticmethod
def getIndexSet(rows):
indexes = set()
for row in rows:
indexes.add(row.getIndex())
return indexes
@staticmethod
def getIndexList(rows):
indexes = []
for row in rows:
indexes.append(row.getIndex())
return indexes
def getRowByRowOriginalIndex(self, index):
for row in self._rows:
if row.getIndex() == index:
return row
return None
class GlobalData(Data):
""" Расширение типа Data, подразумевает хранение всего набора точек, с которыми идет работа.
"""
def getDummyCluster(self, clusters):
""" Находит все точки, не принадлежащие ни одному кластеру.
Под словом dummyCluster имеются в виду все такие точки, которые не входят ни в один кластер
программа работает с ними, как с самостоятельным фантомным кластером. Просто так удобнее.
:param clusters: получает на вход массив всех кластеров
:return: возвращает объект типа Cluster, представляющий из себя набор точек, не входящих ни в один существующий кластер
"""
busyIndexes = set()
allIndexes = set()
for i in range(0, self.rowCount()):
allIndexes.add(i)
for cluster in clusters:
busyIndexes = busyIndexes | cluster.getIndexSet()
unbusyIndexes = allIndexes - busyIndexes
rows = self.getRowsByIndexSet(unbusyIndexes)
dummyCluster = Cluster(self.buildClusterDataFromRows(rows))
dummyCluster.setColor(Constants.DEFAULT_POINT_COLOR)
dummyCluster.setShapeKey('circle')
dummyCluster.setName('dummyCluster')
return dummyCluster
def buildClusterDataFromRows(self, rows):
indexset = Data.getIndexSet(rows)
columns = self.buildColumnsFromIndexSet(indexset)
return Data(columns, rows)
def buildClusterDataFromIndexSet(self, indexset):
rows = Data.getRowsByIndexSet(self, indexset)
columns = self.buildColumnsFromIndexSet(indexset)
return Data(columns, rows)
def buildColumnsFromIndexSet(self, indexset):
newcolumns = []
for column in self.getColumns():
newdata = []
for element in indexset:
newdata.append(column[element])
newcolumn = Column(column.getName(), newdata, column.getIndex())
newcolumns.append(newcolumn)
return newcolumns
class Cluster:
""" Класс, представляющий из себя кластер. Кластер содержит в качестве данных объект типа Data
"""
def __init__(self, data):
self._data = data
self._name = "nameless cluster"
colorRange = Constants.DEFAULT_COLOR_SET
self._color = random.choice(colorRange)
self._shapeKey = "circle"
self._hidden = False
def __getitem__(self, index):
return self._data[index]
def __setitem__(self, index, value):
self._data[index] = value
def __delitem__(self, index):
del self._data[index]
def __len__(self):
return len(self._data)
def setHidden(self, value):
self._hidden = value
for row in self._data:
row.setHidden(value)
def isHidden(self):
return self._hidden
def getName(self):
return self._name
def setName(self, name):
self._name = name
def getColor(self):
return self._color
def setColor(self, color):
self._color = color
def getShapeKey(self):
return self._shapeKey
def getShape(self):
return Utils.getFlippedMarkerDictionary().get(self.getShapeKey())
def setShapeKey(self, shapeKey):
self._shapeKey = shapeKey
def getSize(self):
return len(self._data)
def draw2DProjection(self, axes, xindex, yindex, markersize):
""" Проецирует кластер на плоскость.
:param axes: элемент библиотеки matplotlib на который происходит проекция
:param xindex: переменная на оси X
:param yindex: переменная на оси Y
:return:
"""
points = []
xData = []
yData = []
for row in self._data:
point = row.getProjection(xindex, yindex)
points.append(point)
if not point.isHidden():
xData.append(point.getX())
yData.append(point.getY())
axes.plot(xData, yData,
linestyle="None",
marker=self.getShape(),
color=self.getColor(),
markersize = markersize)
def draw2DProjection_by_given_points(self, axes, xindex, yindex, markersize, xD=[], yD=[]):
""" Проецирует кластер на плоскость.
:param axes: элемент библиотеки matplotlib на который происходит проекция
:param xindex: переменная на оси X
:param yindex: переменная на оси Y
:return:
"""
points = []
xData = xD
yData = yD
axes.plot(xData, yData,
linestyle="None",
marker=self.getShape(),
color=self.getColor(),
markersize = markersize)
def evaluateMassCenter(self):
""" Рассчитывает центр масс кластера
:return: Объект типа Row, представляющий из себя строку, составленную из координат центра масс
"""
rowsAmount = len(self._data)
if rowsAmount > 0:
massCenterDataArray = [0] * len(self._data[0])
for row in self._data:
for i in range(0, len(row)):
massCenterDataArray[i] += row[i]
massCenterDataArray[:] = [element / rowsAmount for element in massCenterDataArray]
return Row(None, massCenterDataArray)
else:
return None
def addRow(self, row):
self._data.addRow(row)
def getIndexSet(self):
return Data.getIndexSet(self._data)
def getInnerData(self):
return self._data
def remove(self, item):
self._data.remove(item)
class Row:
""" Класс представляет из себя строку данных, интерпретируемую как многомерная точка.
Это удобнее чем просто массив, так как этот класс можно расширять по своему усмотрению.
"""
def __init__(self, index, dataArray):
""" Конструктор класса
:param index: каждая строка имеет свой уникальный идентификатор - порядковый номер.
Этот идентификатор очень важен для работы программы
:param dataArray: массив данных
"""
self._index = index
self._dataArray = dataArray
self._hidden = False
def __getitem__(self, index):
return self._dataArray[index]
def __setitem__(self, index, value):
self._dataArray[index] = value
def __delitem__(self, index):
del self._dataArray[index]
def __len__(self):
if self._dataArray is not None:
return len(self._dataArray)
else:
return None
def getIndex(self):
return self._index
def setIndex(self, index):
self.index = index
def setDataArray(self, dataArray):
self._dataArray = dataArray
def setHidden(self, value):
self._hidden = value
def isHidden(self):
return self._hidden
def getProjection(self, i, j):
""" Двумерная проекция строки по координатам c индексами i и j
:param i: координата точки на оси X
:param j: координата точки на оси Y
:return: объект типа Point, представляющий из себя точку на плоскости.
"""
x = self._dataArray[i]
y = self._dataArray[j]
point = Point(x, y, self._index)
point.setHidden(self._hidden) # если колонка является скрытой, то и ее проекция тоже будет скрытой
return point
def distanceTo(self, anotherRow, significancefactors):
""" Рассчитывает евклидово расстояние между этой многомерной точкой и какой-то другой.
Учитывает коэффициенты значимости!
:param anotherRow: другая многомерная точка
:param significancefactors: массив с коэффициентами значимости
:return: возвращает число - расстояние
"""
sumOfSquares = 0
for i, element in enumerate(self._dataArray):
sumOfSquares += (element - anotherRow[i]) * (element - anotherRow[i]) * \
significancefactors[i] * significancefactors[i]
return math.sqrt(sumOfSquares)
def manhattanDistanceTo(self, anotherRow, significancefactors):
"""Рассчитывает манхэттенское расстояние между этой многомерной точкой и какой-то другой.
Учитывает коэффициенты значимости!
:param anotherRow: другая многомерная точка
:param significancefactors: массив с коэффициентами значимости
:return: возвращает число - расстояние
"""
sum = 0
for i, element in enumerate(self._dataArray):
sum += abs((element - anotherRow[i]) * significancefactors[i])
return sum
def matrixMultiply(self, matrix):
rowToReturn = []
for matrixRow in matrix:
newElement = 0
for i, element in enumerate(matrixRow):
newElement += element * self._dataArray[i]
rowToReturn.append(newElement)
return rowToReturn #TODO возвращать объект типа Row вместо просто массива
class Column:
""" Класс представляет из себя колонку данных.
Это удобнее чем просто массив, так как этот класс можно расширять по своему усмотрению.
"""
def __init__(self, name, data, index):
""" Конструктор класса
:param name: имя переменной (колонки)
:param data: массив данных
:param index: номер колонки
"""
# _weight - весовой коэффициент или коэффициент значимости. Влияет на значомость этой колонки, при рассчетах расстояний.
# Вес колонки задается при открытии файла в окне предобработки данных.
self._name = name
self._data = data
self._index = index
self._isSignificant = True
self._weight = 1
def __getitem__(self, index):
return self._data[index]
def __setitem__(self, index, value):
self._data[index] = value
def __delitem__(self, index):
del self._data[index]
def __len__(self):
return len(self._data)
def getName(self):
return self._name
def getIndex(self):
return self._index
def setSignificance(self, boolvalue):
self._isSignificant = boolvalue
def checkSignificance(self):
return self._isSignificant
def getAverageValue(self):
if len(self._data) !=0:
return sum(self._data)/len(self._data)
else:
return 0
def getStandartDeviation(self):
averagevalue = self.getAverageValue()
standartdeviation = 0
for element in self._data:
standartdeviation += (averagevalue - element) * (averagevalue - element)
standartdeviation = math.sqrt(standartdeviation / len(self._data))
return standartdeviation
def setWeight(self, value):
self._weight = value
def getWeight(self):
return self._weight
def append(self, value):
self._data.append(value)
class Point:
""" Простой класс, представляющий из себя двумерную точку на плоскости.
"""
def __init__(self, x, y, index):
self._x = x
self._y = y
self._index = index
self._hidden = False
def __len__(self):
return 2
def getX(self):
return self._x
def getY(self):
return self._y
def getIndex(self):
return self._index
def setHidden(self, value):
self._hidden = value
def isHidden(self):
return self._hidden