From 6393eae466b9d8df96168339998d36721edcb44f Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Florian9041 Date: Thu, 13 Jun 2024 14:08:14 +0200 Subject: [PATCH] Layout en inhoud gecontroleerd na renderen van spp-117-nl --- .../02_onderwerp.Rmd | 12 +- .../04_werkwijze.Rmd | 6 +- .../05_kwaliteitszorg.Rmd | 2 +- .../06_veiligheid.Rmd | 2 +- .../spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/NEWS.md | 2 +- .../media/Figure1.JPG | Bin 14713 -> 39599 bytes .../media/Figure2.JPG | Bin 12785 -> 25715 bytes .../pandoc/inbo_protocol.tex | 568 ------------------ .../spp_117_nl_abiotiek_waterlopen.Rmd | 196 ------ 9 files changed, 12 insertions(+), 776 deletions(-) delete mode 100644 source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/pandoc/inbo_protocol.tex delete mode 100644 source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen.Rmd diff --git a/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/02_onderwerp.Rmd b/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/02_onderwerp.Rmd index 4e8c8b48..0ca0fac5 100644 --- a/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/02_onderwerp.Rmd +++ b/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/02_onderwerp.Rmd @@ -2,19 +2,19 @@ ## Definities en afkortingen -**staalnamelocatie** of **steekproefeenheid:** Voor het project meetnetten natuurlijk milieu (zie verder) komt de steekproefeenheid voor waterlopen overeen met een 100 meter segment van de waterloop. +**Staalnamelocatie** of **steekproefeenheid:** Voor het project meetnetten natuurlijk milieu (zie verder) komt de steekproefeenheid voor waterlopen overeen met een 100 meter segment van de waterloop. Dit is het segment waarvan de abiotische karakterisatie wordt beoogd. Dit segment wordt aangeduid als het meest stroomafwaarts gelegen punt van het te bemonsteren 100 meter segment. -**staalnamepunt**: exacte plaats waar het waterstaal wordt genomen; dit is de meest geschikte dwarsdoorsnede van de waterloop binnen de staalnamelocatie (100 meter segment van de waterloop). +**Staalnamepunt**: exacte plaats waar het waterstaal wordt genomen; dit is de meest geschikte dwarsdoorsnede van de waterloop binnen de staalnamelocatie (100 meter segment van de waterloop). -**oppervlaktewater**: al het permanent of op geregelde tijdstippen stilstaande of stromende water op het landoppervlak, aan de landzijde van de basislijn vanaf waar de breedte van de territoriale zee wordt gemeten (DIW 2003) +**Oppervlaktewater**: al het permanent of op geregelde tijdstippen stilstaande of stromende water op het landoppervlak, aan de landzijde van de basislijn vanaf waar de breedte van de territoriale zee wordt gemeten (DIW 2003) -**staalnameformulier**: formulier waarop de veldmetingen, veldwaarnemingen en opmerkingen in verband met de staalname worden genoteerd +**Staalnameformulier**: formulier waarop de veldmetingen, veldwaarnemingen en opmerkingen in verband met de staalname worden genoteerd -**waterdiepte**: verticale afstand tussen het wateroppervlak en het bodemoppervlak +**Waterdiepte**: verticale afstand tussen het wateroppervlak en het bodemoppervlak -zie definities en afkortingen van de deelprotocols ([sfp-113-nl 2023.04](../2023.04/index.html), [sfp-114-nl 2024.03](../2024.03/index.html), [sfp-115-nl 2024.04](../2024.04/index.html)) +Zie definities en afkortingen van de deelprotocols ([sfp-113-nl 2023.04](../2023.04/index.html), [sfp-114-nl 2024.03](../2024.03/index.html), [sfp-115-nl 2024.04](../2024.04/index.html)) ## Doelstelling, toepassingsgebied en beperkingen diff --git a/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/04_werkwijze.Rmd b/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/04_werkwijze.Rmd index bbb3bc88..ce9a2962 100644 --- a/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/04_werkwijze.Rmd +++ b/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/04_werkwijze.Rmd @@ -160,11 +160,11 @@ Het staalnameformulier (zie [PDF](./media/Veldformulier_water.pdf)) kan ingedeel - Zichtbare verontreiniging van wateroppervlak of waterkolom: - [Maaisel]{.underline} / drijvende plantenresten: op het wateroppervlak drijft er maaisel of zijn er drijvende plantenresten aanwezig. - - [Dode fauna]{.underline}: dode fauna aanwezig (vis, eend, ...) + - [Dode fauna]{.underline}: dode fauna aanwezig (vis, eend, ...). - [Olie]{.underline}:kleurige film (kleurschakering met rood, paars, blauw en geel) op het wateroppervlak. Opgelet: bacteriën kunnen eveneens een dunne film op het water vormen. Bij verstoring van deze film (bv door de inworp van een steen) zal deze laag echter breken in de vorm van barstjes, terwijl een oliefilm zich bijna onmiddellijk terug sluit. - Vast [afval]{.underline}: zoals bv. flessen, banden, fietsen, plastic zakken, blikjes,... - - [Schuim]{.underline}: schuimvormig ten gevolge van algenbloei of tensio-actief schuim (veroorzaakt door detergenten) - - [Algenbloei]{.underline}: het water heeft meestal een groene kleur (, in de duidelijkste gevallen te omschrijven als ‘erwtensoep’; kan ook gepaard gaan met bv. een bruine, blauwe, paarse of rode kleur. + - [Schuim]{.underline}: schuimvormig ten gevolge van algenbloei of tensio-actief schuim (veroorzaakt door detergenten). + - [Algenbloei]{.underline}: het water heeft meestal een groene kleur, in de duidelijkste gevallen te omschrijven als ‘erwtensoep’; kan ook gepaard gaan met bv. een bruine, blauwe, paarse of rode kleur. - [Bloei watervlooien]{.underline}: dit kan het water rood kleuren. Het waterstaal bevat veel zoöplankton als men ziet dat de rode massa kleine beweeglijke organismen zijn. - [Gasontwikkeling]{.underline}: aan het wateroppervlak ziet men kleine blaasjes (gasbellen) die openbarsten. - [Vlokken]{.underline}: samengekoekt materiaal (groot of klein) met onregelmatige structuur in of op de waterkolom (meestal wit, grijs of zwart). diff --git a/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/05_kwaliteitszorg.Rmd b/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/05_kwaliteitszorg.Rmd index 5108e617..8f315a29 100644 --- a/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/05_kwaliteitszorg.Rmd +++ b/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/05_kwaliteitszorg.Rmd @@ -1,7 +1,7 @@ # Extra aspecten van kwaliteitszorg t.o.v. de subprotocols Voor bepaalde werkzaamheden gelden er mogelijk specifieke richtlijnen rond kwaliteitszorg. -Hiervoor kan best het hoofdstuk zie kwaliteitszorg van deelprotocollen ([sfp-113-nl 2023.04](../2023.04/index.html), [sfp-114-nl](../2024.03/index.html), [sfp-115-nl](../2024.04/index.html)) worden geraadpleegd. +Hiervoor kan best het hoofdstuk zie kwaliteitszorg van deelprotocollen ([sfp-113-nl 2023.04](../2023.04/index.html), [sfp-114-nl 2024.03](../2024.03/index.html), [sfp-115-nl 2024.04](../2024.04/index.html)) worden geraadpleegd. ## Richtlijnen diff --git a/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/06_veiligheid.Rmd b/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/06_veiligheid.Rmd index 22d17078..bfd2ec9a 100644 --- a/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/06_veiligheid.Rmd +++ b/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/06_veiligheid.Rmd @@ -6,7 +6,7 @@ Tijdens het veldwerk gelden volgende veiligheidsregels: - Bioveiligheidsmaatregelen voor het voorkomen van de verspreiding van invasieve exoten. -- Veiligheidsvoorschriften van de deelprotocols ([svp-114-nl 2024.03](../2024.03/index.html), [svp-115-nl 2024.04](../2024.04/index.html)). +- Veiligheidsvoorschriften van de deelprotocols ([sfp-114-nl 2024.03](../2024.03/index.html), [sfp-115-nl 2024.04](../2024.04/index.html)). Voorzichtigheid is ten zeerste geboden bij diepe en snelstromende waterlopen, bij weke waterbodem en bij gladde taluds. In deze omstandigheden kan een alternatieve monsternametechniek toegepast worden (zie Werkwijze - Bemonstering waterkolom en vullen van de recipiënten). diff --git a/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/NEWS.md b/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/NEWS.md index 068fc0d5..c902f6f4 100644 --- a/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/NEWS.md +++ b/source/spp/mnm/spp_117_nl_abiotiek_waterlopen/NEWS.md @@ -2,7 +2,7 @@ ## [2024.05](../2024.05/index.html) -- ... +- Omzetting van Word versie van het protocol (oud versienummer 1.0 uitgegeven op 17/02/2021). Er zijn geen inhoudelijke wijzigingen ten opzichte van deze versie. ```{=html} - -# Wijzigingen t.o.v. vorige versies - -## [2024.05](../2024.05/index.html) - -- ... - -```{=html} - -``` - - - - -# Afhankelijkheden - -Placeholder - - - - - - -# Onderwerp - -Placeholder - - -## Definities en afkortingen -## Doelstelling en toepassingsgebied -### Doelstelling -### Toepassingsgebied -### Beperkingen tot de procedure - - - - -# Extra benodigdheden t.o.v. de subprotocols - -Placeholder - - -## Materiaal - - - -# Overkoepelende werkwijze met verwijzing naar subprotocols - -Hieronder een samenvattende opsomming van de te volgen stappen: - -1. Controleer de lijst met benodigdheden en het niveau van de batterijen voor vertrek; - -2. Navigeer met een GPS naar de staalnamelocatie, beoordeel de situatie ter plekke; - -3. Kies een geschikt staalnamepunt en documenteer deze (foto’s); - -4. Bepaal de secchi- en waterdiepte volgens het protocol [SFP-113 2023.04](https://protocols.inbo.be/2023.04/index.html); - -5. Bepaal de stroomsnelheid volgens het protocol [SFP-118](); - -6. Spoel het materiaal voor met water van het staalnamepunt en neem een mengstaal volgens protocol [SFP-114 2024.03](https://protocols.inbo.be/2024.03/index.html); - -7. Neem met de maatbeker een substaal van het mengstaal en voer de veldmeting uit volgens het protocol [SFP-115 2024.04](https://protocols.inbo.be/2024.04/index.html); - -8. Vul en bewaar de recipiënten voor het laboratorium volgens het protocol [SFP-114 2024.03](https://protocols.inbo.be%20/2024.03/index.html) met het overige mengstaal; - -9. Reinig het gebruikte materiaal; - -10. Controleer of het staalnameformulier (zie [PDF](./media/Veldformulier_water.pdf)) volledig is ingevuld, voeg eventuele uitzonderlijke veldwaarnemingen toe; - -11. Breng de stalen en een kopie van het staalnameformulier binnen bij het labo (binnen 24u na het nemen van het eerste staal); - -12. Digitaliseer het staalnameformulier en klasseer de foto’s. - -## Voorbereiding terreinwerk - -Vooraf worden de XY-coördinaten van de staalnamelocatie ingevoerd in een standaard GPS of in een smartphone-applicatie. -Dit is het meest stroomafwaarts gelegen punt van het te bemonsteren 100 meter segment van de waterloop, de steekproefeenheid voor het project meetnetten natuurlijk milieu. - -In juni-september, tijdens een veldbezoek voorafgaand aan de meetcampagne, wordt vastgesteld of het doelhabitat (habitattype 3260) aanwezig is in het waterloopsegment (habitatdefinitie: zie Leyssen et al. 2020 en SVP-403). - -## Lokaliseren en documenteren van staalnamepunt - -Navigeer met behulp van een standaard GPS (nauwkeurigheid ca. 3-5 m) naar de oever van de staalnamelocatie. - -Zoek binnen een afstand van 100 m stroomopwaarts naar een geschikte staalnamepunt en documenteer deze bij een eerste staalnamebezoek (coördinaten met standaard GPS, beschrijving en foto). -Meanders worden hierbij best vermeden door slibophoping in de binnenbocht die kan opwarrelen, grote diepte in buitenbocht (veiligheid) en bijzondere stromings- en turbulentiepatronen in de meanders die kunnen leiden tot kwaliteitsverschillen in de genomen stalen. -De voorkeur gaat dan uit naar een staalnamepunt, gelegen tussen 2 meanders op maximaal 100 meter van het oorspronkelijke coördinaten van de staalnamelocatie (figuur \@ref(fig:Figuur1)). -De voorkeur wordt gegeven aan vegetatieloze of vegetatiearme zones in de waterloop. -Verstoring van de planten leidt tot resuspensie van hierop aanwezig sediment, neerslag en aangroei en kan het staal contamineren. - -```{r Figuur1, fig.cap="Schematische voorstelling van de staalnamelocatie (grijze bol), de zoekzone voor een geschikt staalnamepunt (grijze arcering) en het gekozen staalnamepunt (rode lijn), gelegen tussen de meanders op niet meer dan 100 m van het staalnamelocatie."} -include_graphics("./media/Figure1.JPG") - -``` - - - -# Extra aspecten van kwaliteitszorg t.o.v. de subprotocols - -```{=html} - -``` - - - -# Extra aspecten van veiligheid t.o.v. de subprotocols - -```{=html} - -``` - - - -# Referenties {.unnumbered} - -::: {#refs} -::: - -```{=html} - -``` - - - -```{r, results="asis"} -if (exists("params")) { - if (!is.null(params$dependencies)) { - mdfiles <- paste0(map_chr(params$dependencies, "protocol_code"), - "-", - map_chr(params$dependencies, "version_number"), - ".md") - child_docs <- file.path(map_chr(params$dependencies, "version_number"), - mdfiles) - - child_docs <- child_docs[map_lgl(params$dependencies, "appendix")] - - if (length(child_docs) > 0) { - res <- map(child_docs, knit_child, quiet = TRUE) - cat( - c("# (PART) Subprotocols {.unnumbered}", "", unlist(res)), sep = "\n") - } - } -} -``` - - -