En git, la configuracion se lleva a cabo de la siguiente manera :
git config --global http.proxy http://user:password@proxyapp.unal.edu.co:8080/proxy.pac
git config --global https.proxy http://user:password@proxyapp.unal.edu.co:8080/proxy.pac
Para remover la configuracion
git config --global --unset http.proxy
git config --global --unset https.proxy