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Workshop 2: investigación reproducible en Arqueología, Paleoclimatología y Ecología
Crear un nuevo repositorio UPWELL (Esta semana) con todos los datos integrados
- Crear repositorio
- Crear su webpage
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Instrucciones:
tener instalado Git
tener una cuenta de Github
tener instralado Python:
De mis datos a mi paquete en R
1. La importancia de los Tidy data
2. The “Tidyverse”
library(dplyr)
library(tidyr)
library(readr)
library(ggplot2)
3. Lectura de datos tabulares con el readr package
4. Leer datos basados en la web
5. Manipulación básica de datos
6. Trabajar con grandes conjuntos de datos
Taller am
1. Integración entre GitHub, Zenodo y ORCID
1.1.
Publicar el código del paquete a través de Zenodo tiene varios beneficios.
El código se archiva de forma gratuita.
El código permanece disponible públicamente, incluso si el repositorio de GitHub es removido.
El código obtiene un DOI, lo que facilita citar el código y rastrear el citas. Cada lanzamiento tiene su propio lanzamiento y hay un dedicado DOI que siempre apunta a la última versión. Esto le da al usuario una opción entre citar el código en general o una versión específica.
1.2. ¿Qué es ORCID?
1.3. ¿Por qué integrar Zenodo y ORCID con GitHub?
Configurar la integración tiene la ventaja de que una nueva versión del paquete obtiene automáticamente un DOI único y se agrega a su perfil ORCID.
Configurar ORCID
Crea una cuenta en https://orcid.org
Ir a DataCite (https://profiles.datacite.org/sign_in) y seleccione "Iniciar sesión con Globus", luego "Iniciar sesión con ORCID iD".
Autorizar el acceso a Globus Auth.
Configurar Zenodo
Cree una cuenta con su ORCID en https://zenodo.org/signup/
Una vez por repositorio
Inicie sesión en Zenodo .
Vaya al cuadro desplegable asociado a su cuenta (arriba a la derecha) y elige GitHub.
Busque el repositorio en la lista de repositorios. Utilice el "Sincronizar ahora" botón si no puede encontrar el repositorio. Tenga en cuenta que sólo puede utilizar repositorios públicos.
Cambia el interruptor del repositorio a "On".
2. Revisar Archivos de trabajo
3. Tranformar Archivos exel a LiPD
4. Mapa de los registros