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linux-readme.md

File metadata and controls

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linux系统的熟练

(去可视化概念+练习) 了解 命令+参数+文件 的模式

基础知识:cd -, cd ..  , cd -, history, !5 ,  /home/ , /tmp/ , >,&,jobs,nohup 1,2,0
文件目录操作:ls,cd,pwd,mkdir,rm,mv,cp,touch,head,tail,less,more
系统管理: df,du,top,free,ps,ipconfig,netstat,ssh,scp,
用户权限:chown,chgrp,groups,ls
文本操作:awk,grep,sed,paste,cat,diff,wc,vi 

使用腾讯云实验室的linux服务器:https://cloud.tencent.com/developer/labs/lab/10000

生信软件安装及使用

(官网,例子,conda)

多版本软件发布:NCBI的 blast以及sratoolkit 等等
二进制软件(预编译版本):下载即可使用
C源码软件:官网,readme,安装,解决配置文件及报错
系统软件中心:ubuntu的用apt-get,centos的用yum,macOS的App Store或者brew
成熟的软件管理中心:conda

保证一个纯粹的新手,生物学的本科生,经过3个小时的折腾,达到熟悉linux的命令行界面,学到软件的安装及管理的方法。为组学实战演练打下基础。