diff --git a/qp_woltka/tests/test_woltka.py b/qp_woltka/tests/test_woltka.py index 8d611f1..4b1f1f7 100644 --- a/qp_woltka/tests/test_woltka.py +++ b/qp_woltka/tests/test_woltka.py @@ -196,6 +196,7 @@ def test_woltka_to_array_rep82(self): copyfile(f'{sdir}/none.biom', f'{out_dir}/none.biom') copyfile(f'{sdir}/free.biom', f'{out_dir}/free.biom') copyfile(f'{sdir}/alignment.tar', f'{out_dir}/alignment.tar') + copyfile(f'{sdir}/coverages.tgz', f'{out_dir}/coverages.tgz') success, ainfo, msg = woltka( self.qclient, job_id, self.params, out_dir) @@ -206,9 +207,11 @@ def test_woltka_to_array_rep82(self): exp = [ ArtifactInfo('Alignment Profile', 'BIOM', [(f'{out_dir}/free.biom', 'biom'), - (f'{out_dir}/alignment.tar', 'log')]), + (f'{out_dir}/alignment.tar', 'log'), + (f'{out_dir}/free/coverages.tgz', 'plan_text')]), ArtifactInfo('Per genome Predictions', 'BIOM', - [(f'{out_dir}/none.biom', 'biom')])] + [(f'{out_dir}/none.biom', 'biom'), + (f'{out_dir}/none/coverages.tgz', 'plan_text')])] self.assertCountEqual(ainfo, exp) @@ -336,11 +339,14 @@ def test_woltka_to_array_wol(self): exp = [ ArtifactInfo('Alignment Profile', 'BIOM', [(f'{out_dir}/free.biom', 'biom'), - (f'{out_dir}/alignment.tar', 'log')]), + (f'{out_dir}/alignment.tar', 'log'), + (f'{out_dir}/free/coverages.tgz', 'plan_text')]), ArtifactInfo('Per genome Predictions', 'BIOM', - [(f'{out_dir}/none.biom', 'biom')]), + [(f'{out_dir}/none.biom', 'biom'), + (f'{out_dir}/none/coverages.tgz', 'plan_text')]), ArtifactInfo('Per gene Predictions', 'BIOM', - [(f'{out_dir}/per-gene.biom', 'biom')])] + [(f'{out_dir}/per-gene.biom', 'biom'), + (f'{out_dir}/per_gene/coverages.tgz', 'plan_text')])] self.assertCountEqual(ainfo, exp)