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Avaliação dos Termos DarwinCore com o objetivo de identificar aqueles termos com vocabulário controlado e definir um conjunto de boas práticas no uso do padrão no Brasil, junto com as instituições e organizações que produzem dados.
https://dwc.tdwg.org/terms/
Justificativa
O uso do padrão DarwinCore para compartilhamento de dados e informações em biodiversidade tem aumentado no Brasil, sendo que as instituições, organizações, fundações, programas e projetos de pesquisa em biodiversidade, cada vez mais, publicam seus dados em alguma plataforma digital, nacional ou internacional. Devido a grande heterogeneidade de tipos de dados, coleções e grupos taxonômicos, existem dúvidas relativas ao preenchimento de cada campo da planilha de dados. A discussão do significado dos termos com a adoção de melhores práticas contribuirá para a padronização dos dados corretamente no Brasil, considerando o conjunto de instituições, suas respectivas demandas e diversidade de termos utilizados.
Como discutir um termo
Para iniciar uma discussão sobre algum termo, clique no título das tabelas abaixo. Assim, você será direcionado para a página específica de discussão do termo escolhido.
Para cada termo apresentado:
Identificador: acesso a descrição original do site oficial do Darwin Core (TDWG).
Definição: enunciado que explica o significado de um termo.
Domínio: termo obrigatório exatamente como deveria estar escrito.
Exemplos: vários exemplos segundo o tipo de dados e/ou grupo taxonômico.
Sugestão/discussão de novos termos
O padrão Darwin Core pode não atender às demandas dos dados de biodiversidade do Brasil. Por vezes, orgãos ambientais e outras instituições necessitam incluir, por exemplo: código de licença, orgão financiador, nome do projeto, entre outros. Aqui, sugerimos iniciarmos uma discussão sobre novos termos e, posteriormente, submeter essa sugestão ao TDWG (ver exemplo em tdwg/dwc#413).
Caso você queira sugerir a inclusão de um novo termo, por favor, abra uma issue e justifique essa inclusão.
Uma referência bibliográfica para o registro indicando como deve ser citado quando utilizado.
Domínio
[Referência bibliográfica]
Exemplos
Rand, K.M., Logerwell, E.A. The first demersal trawl survey of benthic fish and invertebrates in the Beaufort Sea since the late 1970s. Polar Biol 34, 475–488 (2011). https://doi.org/10.1007/s00300-010-0900-2
Informações adicionais que existem, mas que não foram compartilhadas no
registro fornecido. Sugere que existem dados que poderão ser disponibilizados mediante solicitação.
Domínio
[Informações não compartilhadas]
Exemplos
Localização não disponibilizada para espécies ameaçadas.
Ações tomadas para tornar os dados compartilhados menos específicos ou completos do que em sua forma original. Sugere que dados alternativos de maior qualidade estão disponíveis mediante solicitação.
Domínio
Exemplos
Ponto centróide (Estado, Município ou Localidade) para obtenção de
coordenada
Um identificador dado ao evento no campo. Frequentemente, serve como um link entre fieldNotes e o evento. Por ser utilizado também como o identificador das parcelas alocadas a campo.
Um identificador dado à ocorrência no momento em que foi registrada.
Muitas vezes serve como um link entre as notas de campo e um registro de
ocorrência, como o número de um coletor de amostras.
Uma lista (concatenada e separada por barra vertical "|") de nomes de pessoas, grupos ou
organizações responsáveis pelo registro da ocorrência original. O
coletor ou observador primário, especialmente aquele que aplica um
identificador pessoal (recordNumber), deve ser listado primeiro.
Uma lista (concatenada e separada) do identificador global exclusivo da
pessoa, pessoas, grupos ou organizações responsáveis pelo registro da
ocorrência original.
O sexo do(s) indivíduo(s) biológico(s) representado(s) na ocorrência.
Domínio
Macho | Fêmea | Hermafrodita | Indeterminado
Exemplos
Macho:
Fêmea:
Hermafrodita: os hermafroditas verdadeiros são animais com intersexualidade, nos quais as gônadas masculinas e femininas se desenvolvem simultaneamente no mesmo indivíduo. (EMBRAPA, 2004)
Floração: registro de planta observado ou coletado em fase de floração. A floração indica abertura das inflorescências, passando pela fase de expansão completa até a liberação do pólen (EMBRAPA, 2004).
Declaração sobre se um organismo ou organismos foram introduzidos em um
determinado lugar e tempo através da atividade direta ou indireta dos
humanos modernos.
Introduzida: espécies que foram introduzidas em um local do qual não faziam parte originalmente. (EMBRAPA, 2004)
Nativa: espécies que são naturais, próprias do ecossistema ou região em que vivem, ou seja, que crescem dentro dos seus limites naturais incluindo a sua área de dispersão. (EMBRAPA, 2004)
Introduzida por colonização assistida: espécies que forma reintroduzidas em um local com o objetivo de restabelecer as populações que estão ameaçadas de extinção ou já extintas. (IUCN, 2013)
O grau em que um organismo sobrevive, se reproduz e expande seu alcance
no lugar e tempo determinados.
Domínio
Cultivada | Nativa | Invasora | Naturalizada | Introduzida | Domesticada | Origem incerta | Origem não conhecida
Exemplos
Cultivada: espécies que normalmente são semeadas ou plantadas por humanos. (EMBRAPA, 2004)
Nativa: espécie que é natural, própria do ecossistema ou região em que vive, ou seja, que cresce dentro dos seus limites naturais incluindo a sua área de dispersão. (EMBRAPA, 2004)
Invasora: espécies que, introduzidas fora da sua área de distribuição natural, ameaçam a diversidade biológica e os serviços ecossistêmicos. (IBAMA, 2022)
Introduzida: espécies que foram introduzidas em um local do qual não fazem parte originalmente. (EMBRAPA, 2004)
Domesticada: a domesticação de espécies vegetais pode ser definida como um processo de seleção para adaptar determinada espécie ao ambiente criado pelo homem, ou seja, ambiente de cultivo. (EMBRAPA, 2004)
Endêmica: espécie animal ou vegetal que é nativa de uma única área geográfica. (EMBRAPA, 2021)
Naturalizada: espécie que foi introduzida intencionalmente ou não em um novo ambiente e que se adaptou e reproduziu com sucesso nesse local. Ao longo do tempo, a espécie estabeleceu-se e aclimatou-se às novas condições ambientais, passando a fazer parte integrante da flora ou fauna de uma região. (EMBRAPA, 2019)
Descrição categórica do grau em que se verificou que o
georreferenciamento representa a melhor descrição espacial possível para
a localização da ocorrência.
Domínio
Não é possível georreferenciar | Requer georrefenciamento | Requer
verificação
Uma lista (concatenada e separada) de identificadores (publicação,
referência bibliográfica, identificador único global, url) da literatura
associada à ocorrência.
Domínio
Exemplos
Christopher J. Conroy, Jennifer L. Neuwald. 2008. Phylogeographic
study of the California vole, Microtus californicus Journal of
Mammalogy, 89(3):755-767.
Uma lista (concatenada e separada) de identificadores (publicação,
identificador único global, url) de informações de sequência genética
associadas à ocorrência.
Uma lista (concatenada e separada) de números de catálogo totalmente
qualificados anteriores ou alternativos ou outros identificadores usados
por humanos para a mesma ocorrência, seja no atual ou em qualquer outro
conjunto de dados ou coleção.
Um identificador para a instância do organismo (em oposição a um
registro digital específico do organismo). Pode ser um identificador
global exclusivo ou um identificador específico para o conjunto de
dados.
Uma descrição do tipo de instância de organismo. Pode ser usado para
indicar se a instância de organismo representa um organismo discreto ou
se representa um tipo particular de agregação.
Um resultado físico de um evento de amostragem (ou subamostragem). Em
coleções biológicas, a amostra de material é tipicamente coletada, e
preservada ou processada destrutivamente.
Um identificador para o conjunto de informações associadas a um evento
(algo que ocorre em um local e horário). Pode ser um identificador
exclusivo global ou um identificador específico para o conjunto de
dados.
A data ou o intervalo durante o qual um evento ocorreu. Para
ocorrências, essa é a data em que o evento foi registrado. Não
adequado para um tempo em um contexto geológico.
Um identificador para o conjunto de informações de localização (dados
associados a dcterms: location). Pode ser um identificador exclusivo
global ou um identificador específico para o conjunto de dados.
Oceano Atlântico | Oceano Pacífico | Oceano Índico | Oceano Antártico | Rio Doce | Rio Amazonas | Rio São Francisco | Lagoa dos Patos | Lagoa Mirim | Mar Mediterrâneo
O nome completo e não abreviado da próxima região administrativa menor
do que o estado província (condado, condado, departamento, etc.) em que
a localização ocorre.
A menor distância em uma faixa de distância de uma superfície de
referência na direção vertical, em metros. Use valores positivos para
locais acima da superfície, valores negativos para locais abaixo. Se
forem dadas medidas de profundidade, a superfície de referência é a
localização dada pela profundidade, caso contrário, a superfície de
referência é a localização dada pela elevação.
A maior distância em uma faixa de distância de uma superfície de
referência na direção vertical, em metros. Use valores positivos para
locais acima da superfície, valores negativos para locais abaixo. Se
forem dadas medidas de profundidade, a superfície de referência é a
localização dada pela profundidade, caso contrário, a superfície de
referência é a localização dada pela elevação.
[Comentários ou notas sobre as condições ambientais do local de amostragem; podem também, quando necessário, indicar níveis de tratamentos utilizados no estudo]
A latitude geográfica (em graus decimais, usando o sistema de referência
espacial dado em geodésico datum) do centro geográfico de uma
localidade. Os valores positivos estão ao norte da linha do equador, os
negativos estão ao sul dela. Os valores permitidos situam-se entre -90 e
90.
A longitude geográfica (em graus decimais, usando o sistema de
referência espacial dado em geodésico datum) do centro geográfico de uma
localidade. Os valores positivos estão a leste do meridiano de
greenwich, os valores negativos estão a oeste dele. Os valores permitidos
situam-se entre -180 e 180.
O elipsoide, dado geodésico ou sistema de referência espacial (srs)
sobre o qual as coordenadas geográficas dadas em latitude decimal e
longitude decimal como baseadas.
A distância horizontal (em metros) da latitude decimal e longitude
decimal dadas, descrevendo o menor círculo que contém todo o local.
Deixe o valor vazio se a incerteza for desconhecida, não puder ser
estimada ou não for aplicável (porque não há coordenadas). Zero não é um
valor válido para este termo.
Domínio
Exemplos
70 (limite mínimo razoável ou após 01/05/2000 de uma leitura de GPS
em boas condições, se a precisão real não foi registrada na época
A razão entre a área do raio do ponto (decimallatitude,
decimallongitude, coordinateuncertaintyinmeters) e a área da
representação espacial verdadeira (original ou mais específica) da
localização. Os valores legais são 0, maior ou igual a 1, ou
indefinidos. Um valor de 1 é uma correspondência exata ou 100% de
sobreposição. Um valor de 0 deve ser usado se o raio de ponto fornecido
não contiver completamente a representação original. O
pontoradiusspatialfit é indefinido (e deve ser deixado vazio) se a
representação original é um ponto sem incerteza e a georreferência dada
não é esse mesmo ponto (sem incerteza). Se a georreferência original e
dada forem o mesmo ponto, o pontoradiusspatialfit será 1.
As coordenadas espaciais originais literais do lugar. O elipsoide de
coordenadas, geodésico datum, ou sistema de referência espacial (srs)
completo para essas coordenadas deve ser armazenado em verbatimsrs e o
sistema de coordenadas deve ser armazenado em verbatimcoordinatesystem.
A latitude original literal do lugar. O elipsoide de coordenadas,
geodésico datum, ou sistema de referência espacial (srs) completo para
essas coordenadas deve ser armazenado em verbatimsrs e o sistema de
coordenadas deve ser armazenado em verbatimcoordinatesystem.
A longitude original literal do lugar. O elipsoide de coordenadas,
geodésico datum, ou sistema de referência espacial (srs) completo para
essas coordenadas deve ser armazenado em verbatimsrs e o sistema de
coordenadas deve ser armazenado em verbatimcoordinatesystem.
O elipsoide, dado geodésico ou sistema de referência espacial (srs) no
qual as coordenadas dadas em verbatimlatitude e verbatimlongitude, ou
verbatimcoordinates são baseadas.
Uma representação de texto conhecido (wkt) da forma (pegada, geometria)
que define o local. Um local pode ter uma representação de raio de ponto
(consulte decimallatitude) e uma representação de pegada, e eles podem
diferir uns dos outros.
Domínio
Exemplos
POLÍGONO (10 20, 11 20, 11 21, 10 21, 10 20) (a caixa delimitadora de um
grau com cantos opostos em longitude=10, latitude=20 e longitude=11,
latitude=21)
A razão entre a área da pegada (footprintwkt) e a área da representação
espacial verdadeira (original ou mais específica) da localização. Os
valores legais são 0, maior ou igual a 1, ou indefinidos. Um valor de 1
é uma correspondência exata ou 100% de sobreposição. Um valor de 0 deve
ser usado se a pegada fornecida não contiver completamente a
representação original. O footprintspatialfit é indefinido (e deve ser
deixado vazio) se a representação original é um ponto sem incerteza e a
georreferência dada não é esse mesmo ponto (sem incerteza). Se a
georreferência original e a georreferenciada dada forem o mesmo ponto, a
pegadaspatialfit será 1.
Uma lista (concatenada e separada) de nomes de pessoas, grupos ou
organizações que determinaram a georreferência (representação espacial)
para o local.
Uma lista (concatenada e separada) de mapas, gazetas ou outros recursos
usados para georreferenciar a localização, descrita especificamente o
suficiente para permitir que qualquer pessoa no futuro use os mesmos
recursos.
Notas ou comentários sobre a determinação da descrição espacial, explicando suposições feitas em adição ou oposição àquelas formalizadas no método referido em georeferenceProtocol.
NOTA: Este termo está sendo utilizado temporariamente para designar quaisquer códigos ou identificadores referentes a parcelas, transectos e similares.
Domínio
[Comentários, notas sobre a georeferenciamento ou identificação do número de parcelas/transectos]
O nome completo do éon geocronológico mais antigo possível ou o eonotema
cronoestratigráfica mais baixa ou o nome informal ("pré-cambriano")
atribuível ao horizonte estratigráfico a partir do qual o item
catalogado foi coletado
O nome completo do último éon geocronológico possível ou eonotema
cronoestratigráfica mais alto ou o nome informal ("precambriano")
atribuível ao horizonte estratigráfico a partir do qual o item
catalogado foi coletado.
O nome completo da era geocronológica mais antiga possível ou da menor
era cronoestratigráfica atribuível ao horizonte estratigráfico a partir
do qual o item catalogado foi coletado.
O nome completo da última era geocronológica possível ou maior era
cronoestratigráfica atribuível ao horizonte estratigráfico a partir do
qual o item catalogado foi coletado.
O nome completo do período geocronológico mais antigo possível ou
sistema cronoestratigráfico mais baixo atribuível ao horizonte
estratigráfico a partir do qual o item catalogado foi coletado.
O nome completo da época geocronológica mais antiga possível ou da menor
série cronoestratigráfica atribuível ao horizonte estratigráfico a
partir do qual o item catalogado foi coletado.
O nome completo da última época geocronológica possível ou maior série
cronoestratigráfica atribuível ao horizonte estratigráfico a partir do
qual o item catalogado foi coletado.
O nome completo da idade geocronológica mais antiga possível ou estágio
cronoestratigráfico mais baixo atribuível ao horizonte estratigráfico a
partir do qual o item catalogado foi coletado.
O nome completo da última idade geocronológica possível ou estágio
cronoestratigráfico mais alto atribuível ao horizonte estratigráfico a
partir do qual o item catalogado foi coletado.
Um identificador para a identificação (o conjunto de informações
associadas à atribuição de um nome científico). Pode ser um
identificador exclusivo global ou um identificador específico para o
conjunto de dados.
Uma breve frase ou um termo padrão ("cf.", "aff.") para expressar as
dúvidas do determinante sobre a identificação.
Domínio
cf. | aff.
Exemplos
cf.: significa que a espécie deve ser a indicada, mas que é preciso conferir, confirmar. (ICZN)
aff.: é uma terminologia taxonômica utilizada em zoologia e botânica para indicar que uma espécie mencionada é relacionada mas não idêntica a espécie no binômio que é demonstrado. (ICZN)
Holótipo: refere-se a um espécime único, a partir do qual é descrita uma espécie ou subespécie. Trata-se de um exemplar singular que desempenha um papel fundamental na catalogação da diversidade biológica. O holótipo é selecionado com base em características distintivas e serve como ponto de referência crucial, estabelecendo padrões para identificação futura e estudos comparativo (UFRJ)
Isótipo: é uma duplicata do holótipo. (USP)
Síntipo: é qualquer um de dois ou mais espécimens citados pelo autor da espécie, quando nenhum holótipo foi designado. (USP)
Lectótipo: é um espécimen ou outro elemento selecionado do material original (por ex. desenhos) e escolhido posteriormente como tipo nomenclatório, quando nenhum holótipo foi designado. Deve ser escolhido inicialmente entre os isótipos ou entre os síntipos. (USP)
Parátipo: são outros materiais citados pelo autor além do holótipo (e isótipos), quando da descrição de uma nova espécie. (USP)
Neótipo: é um espécimen escolhido como tipo nomenclatório, quando todo o material ligado ao táxon descrito foi destruído. (USP)
Uma lista (concatenada e separada) do identificador global exclusivo da
pessoa, pessoas, grupos ou organizações responsáveis por atribuir o
táxon ao assunto.
Um identificador para o conjunto de informações do táxon (dados
associados à classe taxon). Pode ser um identificador exclusivo global
ou um identificador específico para o conjunto de dados.
Um identificador para o uso do nome (significado documentado do nome de
acordo com uma fonte) do táxon atualmente válido (zoológico) ou aceito
(botânico).
Um identificador para o uso do nome (significado documentado do nome de
acordo com uma fonte) do táxon pai direto e mais próximo de
classificação superior (em uma classificação) do elemento mais
específico do scientificname.
Um identificador para o uso do nome (significado documentado do nome de
acordo com uma fonte) no qual o elemento terminal do scientificName foi
originalmente estabelecido sob as regras do código nomenclatural
associado.
Domínio
[identificador do nome original da especie no momento da indentificação]
O nome científico completo. Ao fazer parte de uma identificação, este deve ser o nome na classificação taxonômica de nível mais baixo que pode ser determinado.
Este termo não deve conter qualificações de identificação, que devem ser fornecidas no termo identificationQualifier e deve estar em coerência com o taxonRank.
O nome completo, com informações de autoria e data, se conhecidas, do
táxon pai direto e mais próximo (em uma classificação) do elemento mais
específico do nome científico.
O nome do táxon, com informações de autoria e data, se conhecido, como
apareceu originalmente quando estabelecido pela primeira vez sob as
regras do código nomenclatural associado. O basiônimo (botânica) ou
basônimo (bacteriologia) do nome científico ou o homônimo
sênior/anterior para nomes substituídos.
A referência à fonte na qual o conceito específico de táxon
circunscrição é definido ou implícito - tradicionalmente significada
pelo latim "sensu" ou "sec". (de secundum, que significa "de acordo
com"). Para os táxons resultantes de identificações, deve ser dada uma
referência às chaves, monografias, especialistas e outras fontes.
Domínio
Exemplos
Franz NM, Cardona-Duque J (2013) Descrição de duas novas espécies e
reavaliação filogenética de Perelleschus Wibmer &
O’Brien, 1986 (Coleoptera: Curculionidae), com um histórico completo
do conceito taxonômico de Perelleschus sec. Franz &
Cardona-Duque, 2013. Syst Biodivers. 11: 209-236. (como a citação
completa de Franz &
Cardona-Duque (2013) em Perelleschus splendida sec. Franz &
A classificação taxonômica do nome mais específico no nome científico
como aparece no registro original.
Domínio
sp. | spp. | subsp.
Exemplos
sp.: quando a espécie ainda não foi identificada, o nome do gênero é seguido de sp. (abreviatura de espécie). (ICZN)
spp. : spp.: quando a espécie ainda não foi identificada, o nome do gênero é seguido de spp. (abreviatura de espécies). (ICZN)
subsp.: Abreviatura de subespécie, escrita em fonte normal, com ponto de abreviação. A subespécie é a categoria imediatamente abaixo de espécie. (ICZN)
O status do uso do scientificname como um rótulo para um táxon. Requer
parecer taxonômico para definir o escopo de um táxon. Em seguida, são
utilizadas regras de prioridade para definir o estatuto taxonômico da
nomenclatura contida nesse âmbito, combinado com o parecer dos peritos.
Deve estar vinculado a uma referência taxonômica específica que defina o
conceito.
O estatuto relacionado com a publicação original do nome e a sua
conformidade com as regras de nomenclatura pertinentes. Ele é baseado
essencialmente em um algoritmo de acordo com as regras de negócios do
código. Não requer opinião taxonômica.
Um identificador para o measurementorfact (informações relativas a
medições, fatos, características ou afirmações). Pode ser um
identificador exclusivo global ou um identificador específico para o
conjunto de dados.