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class Arquivo:
def __init__(self, arquivo):
self.arquivo = arquivo
self.dados = None
self.kmer = None
#Arquivo de sequencias.
def abreArquivoSequencias(self):
with open(self.arquivo, 'r', encoding='utf-8') as f:
dados = f.read()
sequencias = self.quebraEmLista(dados)
return sequencias
#Arquivo de entrada/saida.
def abreArquivo(self):
with open(self.arquivo, 'r', encoding='utf-8') as f:
dados = f.read()
return dados
#Obtem as sequências de entrada, trata e quebra em uma lista.
def quebraEmLista(self, dados):
sequencias = dados.replace(' ', '').replace('\n', '').split(',')
self.kmer = len(sequencias[0])
if sequencias[-1]:
return sequencias
else:
return sequencias[:-1]
#Grava no arquivo de Log de teste (Errado/Correto).
def gravaArquivo(self, dados):
with open(self.arquivo, 'a') as f:
f.write(dados+'\n-\n')
return
#Salva os dados no arquivo desejado.
def escreveArquivo(self, dados):
with open(self.arquivo, 'w', encoding='utf-8') as f:
f.write(dados)