Зависимости

pip install Flask
pip install -U pip setuptools wheel
pip install -U spacy
python -m spacy download ru_core_news_sm

Демо

Сопоставление слов. Параметр threshold не очень честно работает для слов, которые при склонении сильно трансформируются.
То есть поиск реактивов вместо использования базы знаний сделать с использованием именованных сущностей. Это решит проблемы вроде следующей:

Токен концентрированной должен ассоциироваться с -> концентрированная серная кислота, однако этого не происходит и сущность не учитывается.
Можно компенсировать с использованием раскрутки вниз - рассмотрения всех связанных слов. Например фенил -> [child] магний -> [child] бромид.
Добавить обработку конъюнкций добавляем реактив1, реактив2.
Связь добавляем реактив (9 мл) распознается как parataxis. Исследовать, насколько это уместно.
Процессинг кореферентных выражений