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BorjaGC24/Asthma_study

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Asthma_study

Scripts y htmls para la realización del trabajo de la asignatura Estudios in silico en biomedicina.

En este github se adjuntan los Rmd usados para el trabajo de la asignatura "Estudios in silico en biomedicina", en donde se pretende hacer un análisis de expresión diferencial y funcional de pacientes con asma en dos edades distintas.

Las distintas carpetas enumeradas contiene el orden y los distintos pasos que se han seguido en la elaboración del trabajo. Además se adjuntan los resultados obtenidos tanto para los términos GO como para las rutas KEGG.

Resumen

El asma es una enfermedad muy extendida a nivel global. Si bien presenta una baja mortalidad, la amplia combinación de factores ambientales y genéticos así como la variación de la enfermedad en función de edad y sexo hacen del asma una enfermedad extremadamente compleja, siendo muy difícil de estudiar, analizar y diagnosticar clínicamente. En este trabajo se pretende analizar dos estudios distintos, uno en jóvenes y otro en adultos, para profundizar en las similitudes y diferencias más remarcables en asmáticos en función de la edad. Con este objetivos se ha hecho uso de distintas herramientas bioinformáticas para el análisis de expresión diferencial y enriquecimiento funcional. Se han identificado una enorme cantidad de genes, se han analizado los términos GO para cada uno de los grupos y se han estudiado las rutas KEGG alteradas más relevantes para estos casos. Como resultados se han obtenido una gran cantidad de términos GO y rutas KEGG alteradas que se pueden agrupar de forma general en predisposición a enfermedades neurodegenerativas, alteraciones metabólicas, problemas con el procesado de proteínas y ácido ribonucleico y alteraciones en las vías sensoriales. A modo de conclusión podemos ver que pese a que el asma es una enfermedad muy heterogénea, sí existen pequeños patrones característicos del asma en función de la edad en la que se presente.

Palabras clave: Asma, Adultez, Niñez, Enfermedad neurodegenerativa, Procesado de proteínas, Metabolismo de ácidos nucleicos.

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