Edición 2024 💜, parte 1
⭐ Objetivo
Fomentar la formación y crecimiento en bioinformática a través de cursos gratuitos para toda la comunidad interesada.
- Viernes de 11:30 am a 1:30 pm CDMX (GMT-6), el horario puede variar unos dias dependiendo del instructor.
- Inicio: 2 de Febrero de 11:30 am a 1:30 pm.
- Clases hibridas en:
- Aula de Bioinformatica de LIIGH
- Google meet
- Grabación de las sesiones 📹.
- Este curso de contempla finalizar hasta julio de 2024 (6 meses).
- Los cambios en horarios se anunciaran por Discord.
Los cursos se imparten cada viernes, se les pide que se inscriban máximo el JUEVES A LAS 6 PM. Solicitudes recibidas posterior a este día y hora, no podrán asistir al viernes de esa semana.
Da click en el siguiente link de Google form
Para cualquier duda o problema mandar un correo con copia a los coordinadores del curso, la Dra. Evelia Coss (ecoss@liigh.unam.mx) y el Dr. Israel Aguilar (iaguilar@inmegen.gob.mx).
Se otorgará un diploma a los participantes que cuenten con el 80 % de las asistencias emitido por el LIIGH-UNAM, teniendo como representante a la Dra. Maria Avila.
- Dra. Evelia Lorena Coss Navarrete (ecoss@liigh.unam.mx) - Posdoc, LIIGH - UNAM
- Dr. Israel Aguilar - Jefe de Bioinformática, INMEGEN
- Sofia Salazar - estudiante de Licenciatura en Ciencias Genomicas, ENES Juriquilla - UNAM
- LCG. Alejandra Schafer - estudiante de doctorado, LIIGH - UNAM
- Dr. Obed Ramirez - Chief Data Scientist (CDS) & Principal Investigator (PI), Solena Ag.
- Dr. Domingo Martinez - Posdoc, LIIGH - UNAM
- Dr. Shaday Guerrero - Posdoc, Centro de Ciencias Matemáticas - UNAM
NOTA: Ahora están disponibles en la página web todos los videos y materiales desde la Playlist.
- Viernes 1. Información general del curso e Introducción a R (2/Feb/2024) - Evelia Coss
- Viernes 2. Manipulación de datos con R base (vector y dataframe) (9/Feb/2024) - Evelia Coss
- Viernes 3. Manipulación de datos con R base (matrix y lista) (16/Feb/2024) - Evelia Coss
- Viernes 4. Introducción a Rmarkdown (23/Feb/2024) - Alejandra Schafer (confirmado)
- Viernes 5. Terapia de Bioinfo grupal (opcional) (1/marzo/2024) - Israel Aguilar
- Viernes 6. Manipulación de datos con funciones de R base (8/marzo/2024) - Evelia Coss
- Viernes 7. Manipulación de datos usando dplyr (15/marzo/2024) - Evelia Coss
- Viernes 8. Generación de diversos gráficos usando ggplot2 (22/marzo/2024) - Sofia Salazar
- Viernes 9. Terapia de Bioinfo grupal (opcional) (5/abril/2024) - Josue Guzman, Israel Aguilar
- Viernes 10. Manipulación de datos para crear un heatmap (ComplexHeatmap) (12/abril/2024) - Sofia Salazar
- Viernes 11. Bioestadistica (19/abril/2024) - Obed Ramirez (confirmado)
- Viernes 12. Bioestadistica (26/abril/2024) - Obed Ramirez (confirmado)
- Viernes 13. Terapia de Bioinfo grupal (opcional) (3/mayo/2024) - Israel Aguilar
- Viernes 14. Exploración de datos y elección de pruebas o modelos (17/mayo/2024) - Domingo Martinez (confirmado)
- Viernes 15. Exploración de datos y elección de pruebas o modelos (24/mayo/2024) - Domingo Martinez (confirmado)
- Viernes 16. Introducción a Python (31/mayo/2024) - Shadday Guerrero (confirmado)
- Viernes 17. Python (7/junio/2024) - Shadday Guerrero (confirmado)
- Viernes 18. Python (14/junio/2024) - Shadday Guerrero (confirmado)
- Viernes 19. Python (21/junio/2024) - Shadday Guerrero (confirmado)
- Viernes 20. Introducción a Bash (28/junio/2024) - Israel Aguilar
- Viernes 21. Introducción a Bash (5/julio/2024) - Israel Aguilar
- Viernes 12 de julio - No hay clase
- Viernes 22. Nextflow (19/julio/2024) - Israel Aguilar
- Viernes 23. Nextflow (26/julio/2024) - Israel Aguilar
- Viernes 24. Nextflow (2/agosto/2024) - Israel Aguilar
- Fecha: Viernes 2 de febrero 2024
- Instructora: Dra. Evelia Coss
- Presentación: Introducción a R
- Grabación: Clase1
- Lecturas y cursos recomendados:
- Fecha: Viernes 9 de febrero 2024
- Instructora: Dra. Evelia Coss
- Presentación: Manipulación de datos con R base (vector y dataframe)
- Grabación: Clase2
- Lecturas y cursos recomendados:
- Fecha: Viernes 16 de febrero 2024
- Instructora: Dra. Evelia Coss
- Presentación: Manipulación de datos con R base (matrix y lista)
- Grabación: Clase3
- Fecha: Viernes 23 de febrero 2024
- Instructora: LCG Alejandra Schafer
- Presentación: Introducción a Rmarkdown
- Grabación: Clase4
- Fecha: Viernes 1 de marzo 2024
- Instructora: Dr. Israel Aguilar
- Presentación: Resolucion de problemas
- Grabación: Clase5
- Fecha: Viernes 8 de marzo 2024
- Instructora: Dr. Evelia Coss
- Presentación: Manipulación de datos con funciones de R base
- Grabación: Clase6
- Script: MarvelvsDCComics_limpieza_script.R
- Output: Variables Info_data.RData
- Fecha: Viernes 15 de marzo 2024
- Instructora: Dr. Evelia Coss
- Presentación: Manipulación de datos usando dplyr
- Grabación: Clase7
- Script: MarvelvsDCComics_Join_script.R
- Input: Vamos a emplear el Output de la clase 6 Info_data.RData
- Fecha: Viernes 22 de marzo 2024
- Instructora: Sofia Salazar
- Presentación: Generación de diversos gráficos usando ggplot2
- Grabación: Clase8
- Script: script_ggplot_clase.R
- Fecha: Viernes 5 de abril 2024
- Instructores: LBt Josué Guzmán Linares, Dr. Israel Aguilar
- Grabación: Clase9
- Carpeta con scripts y data: carpeta en gdrive
- Fecha: Viernes 12 de abril 2024
- Instructora: Sofia Salazar
- Grabación: Clase10
- Script: * get_data.R * heatmap_clase.R
- Data: https://github.com/EveliaCoss/ViernesBioinfo2024/tree/main/Clase_Heatmaps/data
- Manual de Complexheatmap
- Fecha: Viernes 19 de abril 2024
- Instructor: Dr. Obed Ramirez
- Grabación:
- Fecha: Viernes 26 de abril 2024
- Instructor: Dr. Obed Ramirez
- Grabación: Clase12
- Fecha: Viernes 17 de mayo y 24 de mayo 2024
- Instructor: Dr. Domingo Martinez
- Grabación:
- Material:
- Fecha: Viernes 31 de mayo, 7, 14 y 21 de junio 2024
- Instructor: Dr. Shaday Guerrero
- Grabación:
- Material:
- Clase 16 - Plotting and Programming in Python
- Clase 17 - Built-in Functions and Help
- Clase 18 - plotting y listas
- Clase 19- for loops
- Fecha: Viernes 28 de junio y 5 de julio 2024
- Instructor: Dr. Israel Aguilar
- Grabación:
- Material:
- Instalación de una terminal de BASH (PREVIO A LA CLASE)
- Opción A: Instalar una Máquina virtual (VM) en sus computadoras
- Videos explicativos: https://youtu.be/Rt0agy32pFo , https://youtu.be/cInUitD6Wws
- Manuales de instalación: Manuales De Instalación de Virtual Box y Ubuntu
- Opción B: Instalar Git Bashy MobaXterm
- Instalar Git Bash (seguir las instrucciones de instalación https://miguel-mx.github.io/2024-01-24-ccm-unam-swc/)
- Instalar MobaXterm https://mobaxterm.mobatek.net/
- Opción A: Instalar una Máquina virtual (VM) en sus computadoras
- Instalación de una terminal de BASH (PREVIO A LA CLASE)
- Fecha: Viernes 19 y 26 de julio, viernes 2 de agosto 2024
- Instructor: Dr. Israel Aguilar
- Grabación:
El material de los VieRnes de Bioinformatica se distribuye públicamente a través de este repositorio GitHub bajo la Licencia No Comercial Creative Commons 4.0.
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Queremos agradecer al LIIGH - UNAM por el apoyo y facilidades prestadas para poder impartir estos cursos. Queremos explícitamente agradecer, de manera muy especial, a la Dra. Maria Avila, la Dra. Alejandra Medina-Rivera, Licenciada Eglee Lomelin, Jair Santiago y Luis Aguilar por su extraordinaria labor y por impulsar estos cursos para el crecimiento de todos.
Cursos hechos con amor 💜