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Releases: Masterchiefm/NGS_Tools

1.6.3

24 Jan 14:12

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Update

修复了fastq文库二次拆分出来的reads不匹配的bug

1.6.2

21 Jan 15:00

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update

、bug修复
用、mamba安装依赖会更快

1.6.0

21 Jan 06:09

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Update

创建并运行于conda NGS环境,不再在base里拉屎。
指定环境为py3.9,以避免无法安装crispresso

Notice

13 Aug 12:55
2c96b85

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获取二进制包

如果你需要直接运行本程序,请联系我导师mahh@shanghaitech.edu.cn或者我本人moqiqin@live.com
当然你也可以参照README.md中的内容,直接从源码运行。

Hello

本程序的初衷是为了为本组提供方便快捷的数据分析支持,我希望能够在帮助他人的同时得到认可。如果这个程序帮到了你,希望你能在致谢或者其它地方提到本程序的贡献!直接引用本程序的网站也是ok的。

祝大家科研顺利!

Cite this work

doi

If this work helps, please cite my work.

It is recommended that citing the script by a link (such as: NGS_Tools(https://doi.org/10.5281/zenodo.8243045)) or refer to this page Ways to cite a GitHub Repoto promote reproducibility of your work.

1.5.2

20 Jan 13:29
fae8cfe

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#更新
修复并更新了二次拆分。现在二次拆分支持barcode不在第一位的情况,默认只支持barcode在前5位之内,不打算改更长了。

1.5.1

01 Jul 08:15

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功能更新

  1. 添加了单端测序分析的支持。
  2. 文件名识别模式可自定
  3. 更改了打包环境,可在ubuntu22或者以上版本运行

1.5.0

08 May 15:01

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更新

修改了后台多任务并发逻辑,使CPU不再摸鱼。本次改进使得批量分析的总时间大大缩短!

下载

点击下方NGS_Tools.tar.xz下载,解压后即可使用。

update

17 Mar 05:24

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二次拆分后会输出一个样品信息表,BE窗口定位优化

1.2.2

14 Mar 11:58

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优化

做BE分析时,自动判断提供的参考序列是否为被编辑链(sgRNA non-target strand).

若为非编辑链,程序将自动互补配对取得编辑链序列作为新的参考序列输入。

1.2.1

11 Mar 18:25

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update

更新了一些文字描述