Releases: Masterchiefm/NGS_Tools
1.6.3
1.6.2
update
、bug修复
用、mamba安装依赖会更快
1.6.0
Update
创建并运行于conda NGS环境,不再在base里拉屎。
指定环境为py3.9,以避免无法安装crispresso
Notice
获取二进制包
如果你需要直接运行本程序,请联系我导师mahh@shanghaitech.edu.cn或者我本人moqiqin@live.com
当然你也可以参照README.md中的内容,直接从源码运行。
Hello
本程序的初衷是为了为本组提供方便快捷的数据分析支持,我希望能够在帮助他人的同时得到认可。如果这个程序帮到了你,希望你能在致谢或者其它地方提到本程序的贡献!直接引用本程序的网站也是ok的。
祝大家科研顺利!
Cite this work
If this work helps, please cite my work.
It is recommended that citing the script by a link (such as: NGS_Tools(https://doi.org/10.5281/zenodo.8243045)) or refer to this page Ways to cite a GitHub Repoto promote reproducibility of your work.
1.5.2
#更新
修复并更新了二次拆分。现在二次拆分支持barcode不在第一位的情况,默认只支持barcode在前5位之内,不打算改更长了。
1.5.1
功能更新
- 添加了单端测序分析的支持。
- 文件名识别模式可自定
- 更改了打包环境,可在ubuntu22或者以上版本运行
1.5.0
更新
修改了后台多任务并发逻辑,使CPU不再摸鱼。本次改进使得批量分析的总时间大大缩短!
下载
点击下方NGS_Tools.tar.xz下载,解压后即可使用。
update
二次拆分后会输出一个样品信息表,BE窗口定位优化
1.2.2
优化
做BE分析时,自动判断提供的参考序列是否为被编辑链(sgRNA non-target strand).
若为非编辑链,程序将自动互补配对取得编辑链序列作为新的参考序列输入。
1.2.1
update
更新了一些文字描述