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Monlter/Pulmonary-2D-3D-Image-Registration

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数据转换形式

CT:

  • 格式:二进制,float32(.bin文件)
  • 形状:(9830400,)
  • 需要转换的格式:reshape(150,256,256)--256*256为每张图像的大小

DVF:

  • 格式:二进制,float32
  • 形状:(29491200,)
  • 需要转换的格式:reshape(3,150,256,256)--256*256为每张图像的大小

DRR(projection):

  • 格式:二进制,float32
  • 形状:(1800000,)
  • 需要转换的格式:reshape(100,240,300)--240*300为每张图像的大小,其中第25张为标准正投

数据集

  • 位置:
    • Dataset/Digital_phantom :数字模体数据
    • Dataset/Patient: 真实病人数据
  • 结构:
    • Origin
      • CT
      • DVF
      • PCA: 存放每个DVF对应的PCA系数
      • projection:每个CT正向投影的DRR图像
      • DVF_trans_PCA:存放所有DVF的特征向量
    • Product_9dvf
      • projections: 进行数据扩充的DRR图像

程序设置:

  • tools/Config.py : 设置一些基础设置(学习率,batch_size,以及一些文件路径)
  • tools/cfg/xxx.yaml : 特殊设置 (当前输入图像数量,模型,损失函数)
    • pca_space.ymal : 使用空间网络(接受单个图像输入)
    • pca_spaceAndTime.yaml : 使用时空网络(接受序列输入)

程序运行:

  • train.py : 程序训练
  • test.py : 使用训练好的权重进行测试
  • estimate.py : 对测试后的图像进行各个指标的验证

About

Pulmonary Image Registration && 2D-3D && PCA

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