Diversidade Genética e Identificação de Regiões Genômicas Associadas ao Tamanho dos Grânulos de Amido na Cultura da Mandioca (Cassava)
Este repositório contém o código e os dados relacionados ao projeto "Diversidade Genética e Identificação de Regiões Genômicas Associadas ao Tamanho dos Grânulos de Amido na Cultura da Mandioca". O objetivo deste projeto é explorar a diversidade genética na cultura da mandioca (cassava) e identificar regiões específicas do DNA que estão associadas a variações no tamanho dos grânulos de amido.
O projeto seguirá as seguintes etapas principais:
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Coleta de dados: Faremos a coleta de dados genéticos da cultura da mandioca, utilizando informações disponibilizadas pela Embrapa Mandioca e Fruticultura. Esses dados incluirão informações sobre o tamanho dos grânulos de amido em cada amostra.
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Análise exploratória: Realizaremos uma análise exploratória dos dados para entender as características da diversidade genética e as relações com o tamanho dos grânulos de amido na mandioca. Isso envolverá a visualização de distribuições, a identificação de possíveis outliers e a realização de testes estatísticos preliminares.
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Análise de modelos mistos e diversidade genética: Utilizaremos modelos mistos para analisar a diversidade genética relacionada ao tamanho dos grânulos de amido na cultura da mandioca. Esses modelos consideram a estrutura de parentesco entre as amostras e permitem estimar os efeitos genéticos e ambientais na variação do tamanho dos grânulos de amido. Além disso, investigaremos a presença de interações genótipo-ambiente, avaliando como diferentes genótipos respondem em diferentes condições ambientais.
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Análise de associação genômica: Utilizaremos técnicas estatísticas avançadas para identificar regiões do genoma da mandioca que estão associadas ao tamanho dos grânulos de amido. Isso pode envolver a aplicação de modelos de regressão ou análise de associação de variantes.
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Interpretação dos resultados: Analisaremos os resultados obtidos e faremos inferências sobre as relações entre a diversidade genética e o tamanho dos grânulos de amido na mandioca. Discutiremos as implicações biológicas e agronômicas dessas associações, bem como possíveis aplicações práticas para a melhoria da cultura da mandioca.
- Weverton Gomes da Costa (wevertonufv@gmail.com)
Espera-se que este estudo contribua para o avanço do conhecimento sobre a diversidade genética relacionada aos grânulos de amido na cultura da mandioca, fornecendo insights importantes para a compreensão e manipulação de características relacionadas a esse importante componente da planta.