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Converte a tabela de dados ecologicos para o padrão Darwin Core

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erudas-SiBBr/tableconverter

 
 

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tableconverter

Ferramenta criada para conversão de tabela de dados com variáveis ambientais para o formato Darwin Core. A conversão se faz necessária devido ao padrão usado pela a maioria dos pesquisadores ser fora do formato exigido pelo DwC-A.

Comportamento

A ferramenta replica o algoritmo da função melt do pacote reshape2 da linguagem R.

Assumindo que uma tabela contem apenas variáveis ambientais o exemplo abaixo em R realizada a rotação dos dados para o formato necessário.

# carrega a tabela de dados
# precicsa dos parâmetros completos e o encoding geralmente é 'latin1' ou 'utf8' (preferencia utf8)
dados = read.table('tabela.csv', header = T, sep = ',', dec = '.', encoding = 'utf8')

# carrega a biblioteca que converte a tabela dinamica
library(reshape2)

# cria a coluna eventID nos dados
dados$eventid = 1:nrow(dados)

# passa do formato wide para o long
dadosm = melt(dados, id.vars = 'eventid')

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Converte a tabela de dados ecologicos para o padrão Darwin Core

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