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Refactor for RISP
kaelyndunnell · Nov 3, 2024 · 079a37a · 079a37a
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@@ -1,9 +1,18 @@
+[![CI](https://github.com/kaelyndunnell/hisp/actions/workflows/ci.yml/badge.svg)](https://github.com/kaelyndunnell/hisp/actions/workflows/ci.yml)
 # HISP
+
 Hydrogen Inventory Simulations for PFCs (HISP) is a series of code that uses FESTIM to simulate deuterium and tritium inventories in a fusion tokamak first wall and divertor PFCs. 
 
 ## How to Run:
 
-First, run this in the terminal to create a new environment with the right dependencies:
+Clone the repository:
+
+```
+git clone https://github.com/kaelyndunnell/hisp
+cd hisp
+```
+
+Run this command to create a new environment with the right dependencies (eg. dolfinx):
 ```
 conda env create -f environment.yml
 ```
@@ -13,3 +22,23 @@ Then, activate the environment:
 conda activate hisp-env
 ```
 
+
+Install the `hisp` package with:
+
+```
+python -m pip install -e .
+```
+
+This will also install the pip dependencies like `h-transport-materials` and `FESTIM`.
+
+> **_NOTE:_**  Using `-e` with pip will install the package in editable mode, meaning the source code can be modified without having to reinstall the package.
+
+## Run the tests
+
+After cloning the repo and installing hisp, run:
+
+```
+python -m pytest test
+```
+
+> **_NOTE:_**  Make sure to install the test dependencies with `python -m pip install -e .[test]`
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