Skip to content
/ BioDBS Public
generated from lmichan/biocolores

Proyecto para reunir, analizar y usar bases de datos en biociencias

License

Notifications You must be signed in to change notification settings

lmichan/BioDBS

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 

History

31 Commits
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

🔓Open Bioscience Databases **(**BioDBS)

Es un proyecto de investigación centrado en las bases de interes para las BIOCIENCIAS, esto es, ****que sean útiles para investigación y enseñanza en Ciencias Biológicas, Biología, Ciencias de la Vida y Biomedicina , tiene como objetivos reunir las bases de datos en una colección, clasificarlas y curarlas en acceso abierto y en formato amigable para que sean fáciles de encontrar.

Este proyecto forma parte de la Línea d einvestigación BIObits En esta presentación se puede ver los pntos claves del proyecto https://docs.google.com/presentation/d/1XlaaV6Wpb6CGIi8kgs6wJ6RIRM97u5VphowliXJeMnQ/edit?usp=sharing

El plan es trabajar en las siguientas tareas simultáneamente:

  1. La primera parte del proyecto se centra en reunir todas las bases de datos públicas, especializadas y de calidad que descubra en la Web en una colección, para esto probare las siguientes plataformas:
    1. Tagteam la colección 🔓BioDATABASES disponible en https://tagteam.harvard.edu/hubs/biodbs
    2. El anotador social de Hypothes.is en la colección pública 🔓**Biodatabases.**
  2. La segunda sección consiste en registrar las bases de datos en Wikidata
    1. Agregar a Wikidata los 189 artículos y las las 89 bases de datos nuevas de *La edición de la base de datos de investigación de ácidos nucleicos de* 2021 y la colección de bases de datos de biología molecular en línea.
      1. Las anotaciones de los avances están disponibles aquí
      2. Esta es la conversación de Twitter con la que se originó esta idea
    2. Sumar las 1310 entradas catalogadas en Bioregistry que además contienen ontología y recursos.
    3. Adicionar a Wikidata las 1641 bases de datos reunidas en La colección de bases de datos de biología molecular en línea de NAR.
      1. Generar una lista con la cantidad de artículos y bases de datos en cada edición
  3. La tercera etapa consta de reunir la bibliografía en la colección de Zotero denominada **BioDBS.**

Bases de datos biológicas de México https://hypothes.is/search?q=tag%3A%22BiocoleccionesMX%22

Lista de Bases de datos que no funcionan

Hay una gran cantidad de bases de datos que ya no están vigentes, existen muchas fuentes que runen las bases de datos, en en algunos casos indican si ya no están funcionando, pero es dificil estar consultando cada fuente para identificar si las bases de datos están activas o no, por eso nos hemos dado a la tarea de reunir todas las bases de datos que no funcionan mas. APra cada base de datos hemos agregado la siguiente información. *Nombre *URL *Falla *Fuente en la que se encuentra mencionada *Fecha y hora en la que se consultó y registró

https://airtable.com/shrlqUwQLixOZfg2M

image

<iframe class="airtable-embed" src="https://airtable.com/embed/shrlqUwQLixOZfg2M?backgroundColor=teal&viewControls=on" frameborder="0" onmousewheel="" width="100%" height="533" style="background: transparent; border: 1px solid #ccc;"></iframe>

Productos

Bases de datos biológicas en Wikidata https://github.com/lmichan/wikibiodatabases

🐧Tablero BioDBS es una lista de Twitter con las cuentas de este proyecto 📝Anotaciones de materiales sobre bases de datos biológicas en hypothes.is

GitHub

🧰Estoy aprendiendo a usar esta aplicación, mientras tengo más habilidades en ella la usaré solo para difundir el proyecto.

Comunicación

🐦Agradezco mucho comentarios, sugerencias o reflexiones sobre este proyecto, la forma más facil de hacerlo es por medio de Twitter a @Infovestigacion

Español

💻Existe una gran cantidad de información y materiales en inglés, yo prefiero hacerlo en español para poder poner al alcance de cualquier usuario de la región estos materiales en su idioma

Es una gran ventaja poder usar herramientas digitales para traducir desde cualquier idioma así que puedes escribirme en tu lengua yo usaré un traductor para leertlo.

About

Proyecto para reunir, analizar y usar bases de datos en biociencias

Topics

Resources

License

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published