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inst/guide/user_guide_en.Rmd

@@ -139,12 +139,12 @@ Once these new variables added to the initial dataset, the app summarizes the re
 * `peak_steps_5min`: step accumulation per minute averaged over the best 5 continuous or discontinuous minutes.
 * `peak_steps_1min`: step accumulation per minute over the best minute (same result as for `max_steps_1min`).
 * `ig`: intensity gradient.
-* `M1/3`: the count value (in counts/epoch duration) above which the most active 8h are accumulated over the day
-* `M120`: the count value (in counts/epoch duration) above which the most active 120 minutes are accumulated over the day
-* `M60`: the count value (in counts/epoch duration) above which the most active 60 minutes are accumulated over the day
-* `M30`: the count value (in counts/epoch duration) above which the most active 30 minutes are accumulated over the day
-* `M15`: the count value (in counts/epoch duration) above which the most active 15 minutes are accumulated over the day
-* `M5`: the count value (in counts/epoch duration) above which the most active 5 minutes are accumulated over the day
+* `M1/3`: the count value (in counts/epoch duration) at and above which the most active 8h are accumulated over the day
+* `M120`: the count value (in counts/epoch duration) at and above which the most active 120 minutes are accumulated over the day
+* `M60`: the count value (in counts/epoch duration) at and above which the most active 60 minutes are accumulated over the day
+* `M30`: the count value (in counts/epoch duration) at and above which the most active 30 minutes are accumulated over the day
+* `M15`: the count value (in counts/epoch duration) at and above which the most active 15 minutes are accumulated over the day
+* `M5`: the count value (in counts/epoch duration) at and above which the most active 5 minutes are accumulated over the day
 
 
 To compute PAL, total energy expenditure (TEE) related to the period of the day the user wanted to analyse is divided by BMR that is computed to also correspond to the period of the day the user wanted to analyse. TEE is obtained by summing the kilocalories measured during wear time epochs and the kilocalories related to BMR expended during nonwear time epochs (it is assumed that the periods where the device was not worn corresponded to sleeping periods, during which energy expenditure is near of BMR), and by multiplying this sum by 10/9 to take into account the thermic effect of food. In principle, PAL should be computed using the whole day, not a given period of the day. Of course, such calculations may conduct to underestimate TEE and PAL if the device was removed during prolonged periods of physical activity, unless the user manually adds physical activity information into the dedicated boxes of the app as explained above. Moreover, even if the device was correctly worn, the estimate of PAL is very approximate since both BMR and kilocalories are estimated using methods that may not be accurate at the individual level.

inst/guide/user_guide_en.aux

@@ -1,16 +1,5 @@
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@@ -37,8 +26,7 @@
     {1}{118.52275pt}}
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-\newlabel{tab:METsEquations}{{3.1}{11}{Equations\ for\ estimating\ basal\ metabolic\ rate}{table.3.1}{}}
+\newlabel{tab:METsEquations}{{3.1}{11}{Configuration for metrics computation}{table.3.1}{}}
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inst/guide/user_guide_fr.Rmd

@@ -144,12 +144,12 @@ Une fois ces nouvelles variables ajoutées au jeu de données initial, l'applica
 * `peak_steps_5min`: accumulation de pas par minute moyennée sur les 5 meilleures minutes, consécutives ou non.
 * `peak_steps_1min`: accumulation de pas par minute sur la meilleure minute (même résultat que pour `max_steps_1min`).
 * `ig`: gradient d'intensité.
-* `M1/3`: la valeur de count (en counts/période d'échantillonnage) au-delà de laquelle les 8 heures les plus actives sont accumulées au cours de la journée
-* `M120`: la valeur de count (en counts/période d'échantillonnage) au-delà de laquelle les 120 minutes les plus actives sont accumulées au cours de la journée
-* `M60`: la valeur de count (en counts/période d'échantillonnage) au-delà de laquelle les 60 minutes les plus actives sont accumulées au cours de la journée
-* `M30`: la valeur de count (en counts/période d'échantillonnage) au-delà de laquelle les 30 minutes les plus actives sont accumulées au cours de la journée
-* `M15`: la valeur de count (en counts/période d'échantillonnage) au-delà de laquelle les 15 minutes les plus actives sont accumulées au cours de la journée
-* `M5`: la valeur de count (en counts/période d'échantillonnage) au-delà de laquelle les 5 minutes les plus actives sont accumulées au cours de la journée
+* `M1/3`: la valeur de count (en counts/période d'échantillonnage) à et au-delà de laquelle les 8 heures les plus actives sont accumulées au cours de la journée
+* `M120`: la valeur de count (en counts/période d'échantillonnage) à et au-delà de laquelle les 120 minutes les plus actives sont accumulées au cours de la journée
+* `M60`: la valeur de count (en counts/période d'échantillonnage) à et au-delà de laquelle les 60 minutes les plus actives sont accumulées au cours de la journée
+* `M30`: la valeur de count (en counts/période d'échantillonnage) à et au-delà de laquelle les 30 minutes les plus actives sont accumulées au cours de la journée
+* `M15`: la valeur de count (en counts/période d'échantillonnage) à et au-delà de laquelle les 15 minutes les plus actives sont accumulées au cours de la journée
+* `M5`: la valeur de count (en counts/période d'échantillonnage) à et au-delà de laquelle les 5 minutes les plus actives sont accumulées au cours de la journée
 
 
 Pour calculer le NAP, la dépense énergétique totale (DET) liée à la période de la journée que l'utilisateur souhaitait analyser est divisée par le MB, qui lui est calculé pour correspondre aussi à la période de la journée à analyser. La DET est obtenue en faisant la somme des kilocalories mesurées durant le temps de port et des kilocalories liées au MB dépensées durant les périodes de non-port (il est supposé que les périodes lors desquelles l'appareil n'était pas porté correspondaient à des périodes de sommeil, durant lesquelles la dépense énergétique est proche du MB), et en multipliant cette somme par 10/9 afin de prendre en compte l'effet thermique des aliments. En principe, le NAP devrait être calculé en utilisant l'ensemble de la journée, pas une période donnée de la journée. Bien sûr, de tels calculs peuvent conduire à sous-estimer la DET et le NAP si l'appareil était enlevé pendant des périodes prolongées d'activité physique, à moins que l'utilisateur ajoute manuellement des périodes d'activité physique dans les espaces de l'application prévus à cet effet comme expliqué plus haut. De plus, même si l'appareil était correctement porté, l'estimation du NAP reste très approximative étant donné qu'à la fois le MB et les kilocalories liées au temps de port étaient estimées à partir de méthodes qui peuvent ne pas être exactes au niveau individuel.